環保署為改善河川水質，妥善處理生活污水，自92年至今陸續補助地方政府建置57處除污型人工濕地，作為污水下水道系統建設完成前之因應措施，以師法自然生態的方式，營造具有淨化污水功能的人工濕地，減少河川的污染負荷。其中有9處獲選為國家重要濕地，近年來在中央與地方共同努力下，環境營造及生態復育成果豐碩，成為環境教育及休閒遊憩的重要場所。
為推動我國重要濕地保育工作，行政院於99年7月1日核定「國家重要濕地保育計畫」，由內政部營建署、經濟部水利署、行政院農業委員會林務局、教育部及環保署共同辦理。目前全國共有82處國家重要濕地，其中屬環保署補助設置之人工濕地計有9處，包括列為國家級的淡水河流域濕地（計有新海、浮洲、打鳥埤、城林及鹿角溪等5處人工濕地），以及列為地方級的新竹縣頭前溪生態公園、高雄市大樹舊鐵橋人工濕地、屏東縣麟洛人工濕地及臺東縣關山人工濕地等4處。
環保署表示，為推動國家重要濕地保育工作，自100年至102年補助地方政府辦理濕地保育、復育、監測、生態調查、教育宣傳等事項。在中央與地方政府積極努力下，上述9處人工濕地除維持原本水質淨化功能外，濕地內生態物種日益豐富，依據生態調查結果，9處濕地內出現的鳥類由100年的109種增加至102年的111種，魚類則由35種增加為36種，兩棲爬蟲類也由35種增加為38種，物種多樣且生態系穩定，並逐漸轉型成兼具生態、教育、休憩等多元化的場所。例如新北市政府於101年打造了「濕地故事館」，將濕地保育工作向下扎根。新竹縣頭前溪生態公園在102年度更成為9處中第1個依據「環境教育法」取得環境教育認證場所的濕地，賦予人工濕地更系統化的教育功能。高雄市大樹舊鐵橋人工濕地在88風災後受損嚴重，在當地志工積極投入復育工作下，已回復往日風采。其餘如麟洛及關山等人工濕地，結合自行車道的規劃，成為地方政府推廣休閒觀光旅遊的重要景點。
環保署指出，過去幾年在中央及地方政府、NGO團體、河川巡守隊與民眾的投入參與下，除了這9處人工濕地外，也創造出許多成功的人工濕地經營典範，如臺北市關渡自然公園內的關渡心濕地、高雄市二仁溪畔的白砂崙濕地等。為珍惜這得來不易的成果，環保署將持續推動保育工作，讓人工濕地結合當地特色開創多元價值，型塑出更豐富的濕地風貌。
環保小常識—除污型人工濕地：
仿效自然濕地的淨化功能，以人工方式在水域窪地底層鋪設土壤、砂、礫石等混合成之填料介質，並種植具有水質淨化功能之植物，將污水導入後透過土壤過濾、吸附、沉澱、水生植物吸收及微生物分解機制等作用，去除污水中的有機物及懸浮固體，進而淨化水質。