立法院社會福利及衛生環境委員會審查102年度環境保護署及所屬機關預算，做成主決議：「應參酌規費法規定，儘速檢討現行『環境影響評估書件審查收費辦法』之合理性。」後並於102年度公務預算審查決議第13項敘明：「凍結行政院環境保護署102年度預算第3目『綜合企劃』項下『環境影響評估』編列2,533萬4,000元之5之1，應公告新版之符合立法院歲入增加決議的環評書件審查收費表並建立環評委外預審制度後，始得動支」。環保署乃依前開立法院決議內容，辦理「環境影響評估書件審查收費辦法」修正。
鑑於近來特大型之重大開發個案，涉及可能影響之生活環境、自然環境、社會環境及經濟、文化、生態等程度及範圍，日趨廣泛及複雜，環保署表示，經檢討現行收費金額尚不足支應目前審查費用實際支出，擬提高現有之收費標準，以反映實際審查成本。
環保署強調，為廣徵各界意見，後續將依法制程序辦理公聽會等作業，對於該收費辦法修正草案內容有任何建言者，可於修正草案預告期間或公聽會時提出修正意見或建議，俾使修正草案內容更加完備。