環保署為加強垃圾焚化廠焚化底渣再利用的管理，於96年7月26日公告修正「一般廢棄物-垃圾焚化廠焚化底渣再利用管理方式」，以經篩分、篩選等前處理後的底渣再利用產品，分類型訂定品質標準，限定各類型再利用產品的用途，規定再利用機構應申報產量、流向，並實施確保環境安全之三級管理制度，以控管底渣品質，以使焚化底渣再利用能達環境無害及工程應用的雙重目標，妥善規範垃圾焚化廠焚化底渣的再利用。
環保署表示，焚化底渣所含重金屬極少，這些底渣經過磁選、篩分等處理程序後，除可獲得鐵金屬、非鐵金屬等有價物質外，篩選後的再利用產品，即可作為工程級配用料、磚品添加料、瀝青混凝土添加料、無筋混凝土添加料等用途。國內外相關研究亦顯示，這些材料可作為道路底層基層、製磚、水泥替代料等用途，先進國家早已廣泛作為路基、覆土、堤防等材料，以歐洲國家為例，底渣再利用率平均達六成，丹麥及荷蘭更高達九成。爲推動垃圾焚化廠焚化底渣的再利用工作，環保署已於91年10月11日、92年6月12日，修正公告「一般廢棄物-垃圾焚化廠焚化底渣再利用管理方式」，自92年起至95年12月底，底渣再利用量已達84萬公噸以上，已將底渣應用於道路管溝回填料、瀝青混凝土等用途。
為使焚化底渣再利用時，更能達環境安全及工程品質，環保署參考先進國家廢棄物再利用分級管理制度，並將確保公共工程施工品質之三級品管制度納入修訂，並辦理公聽及研商會議，參酌各界反映意見後完成修正該公告，藉以妥善規範垃圾焚化廠焚化底渣的再利用工作。
該署表示，本次修正公告之垃圾焚化廠焚化底渣再利用管理方式，係將經篩分、篩選等前處理後的底渣再利用產品分成第一類型、第二類型、第三類型，並且訂定各類型的品質標準及再利用用途，規定再利用機構應於再利用前，至少每500公噸進行重金屬毒性特性溶出程序（TCLP）、氯離子含量及戴奧辛總毒性當量濃度之檢測，符合各類型的再利用產品的品質標準後，依規定的用途進行再利用，同時規定再利用機構應實施第一級自主品質管制系統、縣市政府應實施第二級品質保證系統、環保署應實施第三級品質查核系統之三級管理制度，以確保底渣再利用產品品質，避免再利用時對環境造成危害，另對於底渣再利用後的管制，亦規定再利用機構應進行書面及網路申報產量、流向並且紀錄，以使環保機關明確掌握底渣再利用詳細情形。
環保署表示，一般廢棄物-垃圾焚化廠焚化底渣再利用管理方式修正公告已詳載於該署網頁（網址：http://w3.epa.gov.tw/epalaw/index.aspx），民眾可自行上網查閱。該署也呼籲，再利用機構及使用單位應依該管理方式相關規定進行再利用，環保機關亦會進行監督及查核工作，以有效管理焚化底渣的再利用。