針對彰化縣線西及伸港地區鴨蛋戴奧辛污染事件，環保署已成立危機處理小組，並強化跨部會聯繫機制，並已進行該地區污染源查核及環境介質之戴奧辛採樣分析作業，及積極辦理集塵灰非法棄置場址之清理作業，同時已邀集環保、衛生及動物方面之專家學者，成立跨部會專家學者調查小組，請其提供必要之專業技術及建議，以早日查出污染來源。
環保署為因應彰化縣線西鄉及伸港鄉鴨蛋污染事件，已於94年9月30日成立危機處理小組，經過兩週來密集開會研商結果，並加強跨部會聯繫機制，目前重新審視過去所有檢測資料，完成污染源查核及環境介質之戴奧辛採樣分析作業整體規劃作業。
環保署表示，依前述作業原則，危機小組已分別於10月14日、10月19日赴宜蘭及彰化地區進行2次採樣作業，合計本年度已進行11次採樣，其中宜蘭地區養鴨場之採樣將作為對照組參考，未來將彙整歷次檢測採樣資料，建置各養鴨場之戴奧辛風險地理管理系統，以確實掌握戴奧辛污染源資料。
另環保署與農委會、衛生署並已於日前共同邀集環保、衛生及動物方面之專家學者，成立跨部會專家學者調查小組，包括：臺灣大學王榮德教授、臺灣大學陳保基教授、中興大學許振忠教授、臺灣大學詹長權教授、成功大學李俊璋教授、雲林科技大學張艮輝教授及臺北科技大學林文印教授等7位，預計安排於10月20日至彰化地區現勘，並於10月27日召開第一次會議，未來將請 各專家學者重新審視所有檢測結果提供專業上之協助，以科學驗證方式早日查出污染來源。
環保署表示，為減少戴奧辛空氣污染問題，環保署已於94年10月12日發布「鋼鐵業集塵灰高溫冶煉設施戴奧辛管制及排放標準」，將可有效管制工廠戴奧辛排放問題。另為解決廢棄物戴奧辛問題，該署亦針對彰化地區集塵灰非法棄置場址，積極協調縣市環保局及相關單位（如工務單位、鄉公所等），加速辦理清理作業及加強勾稽相關工廠之廢棄物進出量確認作業，以確保民眾之健康。
另環保署目前除了積極進行污染來源之清查外，也將加強各項環境介質之監控，期能從各個不同管制面向，加強相關的施政作為，以防微杜漸。