環保署98年1月正式啟用東沙島背景測站，展開南海地區環境品質監測，迄今已1年，監測結果顯示東沙島環境品質優良，東沙背景測站為我國最南端環境背景測站，藉由其優越之地理位置，98年9月加入美國航空及太空總署（NASA）氣膠監測網（AERONET），參與全球背景監測（如附件1），提供空氣污染物區域性傳輸重要資訊。
環保署表示，東沙島背景測站扮演我國環境品質監測「前哨站」的任務，對於南海及周邊區域環境品質維護具有重要意義。該站設置大氣輻射儀器，透過大氣輻射各波段能量之監測，反演大氣中懸浮微粒、臭氧、水氣等項目之變化。監測資料透過海洋國家公園管理處網路設備，逐時傳回環保署資料庫系統，目前已累積一年資料，該資料將有助於探討區域性污染物傳輸特徵，掌握長程傳輸污染物對我國之影響。
環保署表示，東沙島背景測站與鹿林山國際背景測站都已加入美國航空及太空總署（NASA）氣膠監測網（AERONET），參與全球背景環境監測，未來將積極推動國際間監測資料交換與數據比對，提升我國在國際上之能見度，並對東亞、南亞地區空氣污染傳輸提供第一手資訊。