環保署日前協同地方環境保護局、環保警察隊及環境督察總隊執行重點河川暗管查處，在短短河段內，分別於台南縣三爺溪查獲十二支、鳳山溪查獲十一支不明管線，並將現場非法排放污染業者移送法辦，顯見不法業者污染行為猖獗，亟待政府公權力嚴懲重罰，還給河川清淨的一面。
環保署表示，對於事業排放廢水管制工作，經過環保單位多年努力，絕大部分事業已完成水污染防治設備設置，水污染稽查作業也以工廠放流水水質採樣稽查的主要方式，轉變為要求業者主動守法，誠實申報的管理方式，藉由許可制度、定期檢測申報紀錄、業者自行紀錄資料及環保人員進行資料及現場查核，促使業者確實操作廢(污)水處理設施。在河川污染整治行動年執行以來，環保署及地方環保單位集中人力強力稽查，部分業者表示廢(污)水處理設施正常運轉中，然而臨近河川污染依舊。經深入調查，展開地毯式搜尋後，終於揪出污染元兇為河底不明管線。對這些不明管線，除了責成地方政府依水污染防治法第十六條予以公告廢止外，並邀集水利局、農田水利會及鄉公所等，確認非屬公共排水管線，於公告期限屆滿後，若仍無人認領，予以封閉或排除。
環保署表示，河底不明管線埋設其來有因，部分業者為規避環保稽查，表面上裝置水污染防治設備應付檢查，實際上，於廠內設置大型調整池或貯槽後，另埋設尺寸六吋至十二吋排放管線，再利用夜間、清晨或假日偷排。由於管徑大，瞬間就把數十噸廢水偷排殆盡，更因河岸邊環境危險崎嶇不平，稽查人員不易採證，管線甚至於暗藏於渠道涵洞內，更加深稽查工作的困難度，執行不易。因此，查獲暗管，依法公告廢止並拆除，其有污染事實者，依水污染防治法予以重罰，處新台幣六萬元以上六十萬元以下罰鍰，並通知限期改善，如排放有害健康物質觸犯刑責部分並移送法辦。統計至十二月止，共對已查獲不明管線排放污染處分十五件，處分金額達三百萬元，並將負責人移送法辦四件。
環保署再次重申澈底改善河川污染之決心，希望不法業者勿以身試法，應澈底檢討改善，勿再存有投機取巧的心理，無論夜間或假日，環保稽查人員都會針對污染嫌疑者進行查核，同時，環保署已於各河川流域推動成立水環境守望相助巡守隊，期望大家共同參與關心河川污染整治，維護清淨河川家園。環保署為鼓勵檢舉不法，更提供最高二十萬的污染檢舉獎金，對勇於舉發不肖業者污染河川的民眾實質鼓勵，希望民眾多利用○八○○○六六六六六環保報案專線，檢舉污染製造者。