為確保霄裡溪水體用途之水質，環保署積極協調霄裡溪上游友達、華映二事業，在維護霄裡溪水體用途為目標的前提下，研提「水質優化方案」，朝「全回收、無製程廢水排放」之方向進行規劃辦理，以弭平各方爭議與疑慮。
基於確保霄裡溪水體用途之水質目標，並遵照監察院調查案請相關單位於3個月內解決本案爭議之意見，環保署協調二事業提出具「建設性」之水質優化方案，朝「全回收、無製程廢水排放」進行規劃。且為促使二事業所提方案能儘速獲致各方共識並落實執行，環保署已二度邀集本案相關單位(包括新竹、桃園二縣政府，華映、友達二事業及經濟部工業局)研商方案內容，並於101年11月22日會議中，獲致重要結論如下：
一、華映及友達二事業，所提放流水水質優化計畫，均以維護霄裡溪水體用途為目標。
二、友達所提之水質優化方案，將朝全回收、無製程廢水排放之方向推動，因涉排放許可證水污染防治措施資料之變更，請友達就變更內容，立即報請桃園縣政府審核，有關水質優化必要之執行期程，請桃園縣政府儘速會商相關機關後確定。
三、前項變更內容如涉及原環境影響評估書件變更，應依環境影響評估法相關規定辦理。
四、請華映儘速參照友達提出之放流水水質優化方案，以全回收、無製程廢水排放為改善目標進行規劃。
因考量二事業係朝向對環境友善之方式進行改善，且相關工程尚須必要之作業時間，環保署持續督促二事業及桃園縣政府加速辦理相關作業，其執行期程須會商相關機關後確定。環保署重申，相關單位應督促二事業落實執行具各方共識之「水質優化方案」，以確保對承受水體之保護，並依法解決本案爭議。