今(99)年3月20日第一例登革熱本土病例發生於高雄市鼓山區，環保署沈署長世宏與衛生署張副署長99年4月13日於行政院南部聯合中心主持第1次登革熱流行疫情處理協調會報，呼籲民眾提高警覺，立即指示各縣市環保局規劃啟動三級複式動員檢查作業，提早因應預防流行病學專家預估今年可能發生之登革熱大流行。
環保署表示，為有效清除登革熱病媒蚊孳生源，全民主動清除自家內外的孳生源，才能迅速有效遏阻登革熱的傳播。環保署強調，民眾住戶內外任何積水容器，包括花瓶、盛水盤、廢輪胎、廢水桶、廢保利龍、廢寶特瓶、廢棄鍋碗、地下室等，都是登革熱病媒蚊孳生源，環保署呼籲民眾一定要依照「清除登革熱病媒蚊孳生源自我檢查表」徹底檢查清除，另對積水容器要定期巡、倒、刷、清，才能落實阻絕登革熱孳生源，當有病例發生時，必要時並結合衛生單位同步進行戶內外環境清潔作業。
環保署表示，將要求各縣市環保局於5月中旬啟動，並持續至7月中旬執行三級複式動員檢查專案計畫。三級複式動員檢查計畫，乃結合全國各縣市環保單位、衛生單位、鄉鎮市單位及村里共同執行。首先由村里宣導民眾每天至少打掃居家環境及家戶自行檢查，清理登革熱病媒蚊孳生源後，由各鄉鎮市區交互檢查相鄰鄉鎮市之村里執行清除孳生源成果；同一日再由各縣市環保、衛生單位隨後抽查鄉鎮市區之各村里，抽選至少10%村里，於該村里排定開始互檢時間後之1小時，依「村里評比路線圖」於同一路線尾隨進行複查，依檢查表實施檢查，並由縣市環保局將轄內及格之村里清單彙整送環保署辦理追蹤複查；環保署則會同衛生署共同派員於各縣市互檢同日於每縣市至少抽選10個村里進行追蹤複查；其中5個複查村里互檢結果，另5個複查縣市環保局已複查之村里。
環保署表示，去(98)年推動「清淨家園總動員家戶消滅登革熱專案計畫」，從北到南動員全國25縣市、368個鄉鎮市區及7,832個村里，並於6月29日至7月10日透過全國各縣市村里互檢、地方衛生環保單位複查及中央衛生環保單位追蹤複查之三級複式動員機制，在中央、縣市、鄉鎮市區及村里攜手合作下，總計發現住宅室外堆置廢棄容器或雜物共32,158處、住宅室內容器、雜物或場所積水未洗刷乾淨者共9,682處，至98年7月26日世運閉幕當天，並無再新增本土登革熱病例。另98年8月值莫拉克風災嚴重淹水，引起登革熱病例數增加，因此規劃南部5縣市於98年12月底至99年1月再次辦理「南南高高屏登革熱孳生源複式動員檢查評比計畫」，總計完成南部5縣市2,105個村里互檢，縣市環保衛生單位複查221個村里及環保署追蹤複查160個村里，清除戶外廢棄容器或雜物共4,979處，住宅室內積水容器計746處。
環保署指出，「清除登革熱病媒蚊孳生源自我檢查表」及「各級單位登革熱病媒蚊孳生源檢查表」已建置於環保署全球資訊網（網站首頁>環保業務>環境衛生及用藥>登革熱相關資料），歡迎民眾下載使用。