國內公有掩埋場營運管理品質攸關附近環境衛生，必須確保其營運水準，才能有效保障週邊的環境與衛生安全，因此環保署自95年開始已邀請專家學者及環保團體共同參與掩埋場體檢作業。
環保署表示，以96年為例，已完成27場營運中及3場已封閉公有垃圾掩埋場總體檢，同時進行35場70口監測井地下水質採樣檢測工作，30場次總體檢結果，掩埋場缺失在於進場管制、管理資料保存及紀錄、覆土、環保及勞安專責人員、勞工健康檢查及安全訓練等未落實執行，顯示公有掩埋場營運管理仍有部分待努力改進的空間；惟其中仍有表現較好的掩埋場，如台南縣安定區域性灰渣衛生掩埋場，該場的區域性滲出水處理廠是處理該縣各鄉鎮市掩埋場滲出水，在縣環保局與操作廠商共同管理下，整體營運管理良好，其管理方式可作為其他掩埋場之參考模式。
今（97）年度從7月份開始執行，環保署持續邀請專家學者及環保團體共同參與總體檢作業，藉由專家學者及環保團體實地勘查，輔導管理機關進行改善並提供相關技術之諮詢外，對於有污染之虞的掩埋場，將賡續追蹤瞭解各衛生掩埋場之營運現況及缺失，提供改善建議並協助輔導，以有效提昇營運管理成效，減少環境污染，俾做好垃圾處理工作。