一、日月光高雄廠稽查處分紀錄問題
（一）100年至102年12月8日止共計告發21次，其中環保署稽查大隊告發5次。
（二）本署南區大隊曾於100年8月18日派員督察K7廠放流水導電度454.4umho/cm、451.9 umho/cm明顯低於前一處理設施（最終中和槽）導電度2954 umho/cm、3030 umho/cm之50％，有加自來水稀釋之實，依違反水污染防治法第18條規定，函請高雄市政府依法告發處分。
（三）101年9月25日、11月27日派員深度查核K5廠，發現其放流水COD 169mg/L、124 mg/L未符合標準；12月19日查核其廢水處理各單元水質均符合放流水質標準，COD去除效果56％後，始回歸民眾有陳情才前往稽查正常機制。
（四）該公司依本署南區督察大隊深度查核建議，陸續於101年8月開始設置即時自動監測紀錄器監測水質，於101年10月完成。監測水質項目為：懸浮微粒(SS)，化學需氧量（COD），氫離子濃度（pH）。
二、10月1日故障未報備問題
（一）高雄市環保局於102年10月1日於德民橋下排水道發現正排放廢水，現場檢測pH為3.02，經追查污染源確為該日月光K7廠所排放，後進入該廠地下室放流槽採樣，現場檢測pH2.63；放流水導電度明顯低於前一處理設施導電度之百分之五十，另採樣放流水水質乙組送驗〈檢測項目：COD、懸浮固體、鎳〉，檢測結果COD 135mg/L、懸浮固體 96 mg/L、鎳 4.38 mg/L、pH 2.63，超過放流水管制標準，分別違反水污染防治法第7條第1項暨檢測申報管理辦法第14條第2項第3款等規定。
（二）日月光半導體製造股份有限公司於102年11月14日日月光封〈102〉環水字第1114-01號函提陳述意見表示：係因為該廠純水造水製程更換鹽酸再生藥桶止漏墊片故障時，意外導致鹽酸約2.4噸流入廢水廠，因設備負責人執行現場緊急應變與處置，而未依規定及時通報，並未有蓄意違反水污染防治法規定。
（三）本次故障未向高雄市環保局報備，已違反水污染防治法第28條規定。放流水不合格是經常或偶發可從連線紀錄中查看獲得，高雄市府查核日月光自動監測記錄，確有發現偶發之pH異常情形。102年度至12月9日前環保單位稽查33次及查核自動監測記錄，有發現1次用水量超出，及1次水質不合格，即10月1日之故障事件。
三、暗管及偷排爭議問題
（一）經濟部加工出口區管理處於95年1月12日同意日月光半導體股份有限公司K5、K7、K9、K11申請接管納入污水下水道系統後海洋放流。日月光並於申請函中說明平常不用，於設備維修等需要緊急排放時使用，先向經濟部加工出口區管理處申請排放，且廢水處理至合格後，排至加工出口區揚水站海洋放流。
（二）日月光於99年4月12日向加工出口區申請4月17日陸放管維修期間K5、K7廢水排入加工出口區汙水下水道系統，所有過程均副知高雄市政府環保局。經高雄市政府於4月22日函日月光及加工出口區請其依「經濟部加工出口區管理處規定辦理」，並要求事後副知廢水檢測結果。顯然市政府已知日月光設有管線連接至加工出口區海洋放流系統，並要求其依「經濟部加工出口區管理處規定辦理」排放申請即可，如今稱其為暗管，市府須對外澄清。
（三）日月光於102年9月26日以正本公函告知高雄市政府，10月5日中水回收管線與陸放管連接的施工期間，K5、K7之廢水將緊急排入加工出口區汙水下水道系統。高雄市政府迄未回覆，此與99年間要求日月光依「經濟部加工出口區管理出規定辦理」即可之意旨相同。日月光向經濟部加工出口區管理處申請於102年10月5日海放，經濟部加工出口區管理處同意海放量為每日6000CMD。另該公司因未施作完成再以電話向經濟部加工出口區管理處申請10月6、7日繼續排海洋放流，即未再副知高雄市政府。總計K7廠排放7040 噸【5日3300 CMD、6日3300 CMD 、7日440 CMD】廢水，K5廠排放5760 噸【5日2700 CMD、6日2700 CMD 、7日360 CMD】廢水。高雄市政府於12月12日稽查時指稱此項行為係偷排，與其過去要求日月光依「經濟部加工出口區管理處規定辦理」即可之處分不一致，且未於10月5日施作前告知日月光，市政府須向外說明改變的理由。
四、以汙泥量偏低估算不法利得問題
環保署督察大隊至高雄，協助市府計算日月光違法之不當利得。係暫以理論汙泥量估計不當利得約為1.1億元，惟此項估計需佐以汙水處理設施現場功能測試完成後，方可確認是否確有汙泥產生量偏低現象。此項功能測試約需再進行三天，方可獲知答案。
綜上，高雄市政府對於日月光違法情節，是否構成惡意違法而達勒令停工程度，須審慎裁量妥適處理。做成決定時，市長需對外詳細說明。