環保署刻正積極籌備2006年國家永續發展會議，為回應民間團體關心國家永續發展，環保署協助台灣生態學會等6個環保團體於95年1月8日至17日於北、中、南、東及離島區域辦理6場次之會議或論壇，期藉由第三部門（NGO/NPO）的意見來檢視各項國家永續發展有關政策，共同追求我國之永續發展。
環保團體區域論壇分別由6個環保團體辦理，東區會議由南島社區大學發展協會於1月8日在台東市南島採集館舉辦、離島會議由澎湖縣環境保護協會於1月12日在澎湖縣長春飯店舉辦、北區會議由主婦聯盟環境保護基金會於1月13日在台北市NGO會館舉辦、中區會議由台灣生態協會於1月14日在台中靜宜大學生態館舉辦、南區會議由永續台灣文教基金會於1月15日在台南市勞工休假中心舉辦、離島論壇由台灣環境保護聯盟於1月17日在台北市NGO會館，邀請金門、馬祖、蘭嶼等離島地區代表與會。
為落實總統永續台灣的理念，行政院國家永續發展委員會訂於本（95）年4月22日（地球日）召開「國家永續發展會議」，並由環保署承辦本項工作，會議規劃為辦理25縣市座談會議、民間團體區域論壇會議、分區座談會議、預備會議及大會。
環保署強調，本次會議非政府組織（NGO）及民眾參與機制非常重要，因此在議題蒐集特別規劃：（一）由政府部門召開縣市座談會、（二）由民間團體召開區域性論壇、（三）於環保署網站設置永續發展專案網頁供民眾反映意見等三個方式，透過由下而上的機制來蒐集議題，以提昇永續發展相關領域之深度與廣度，並進而凝聚社會共識。
環保署表示，該署自94年11月24日起至12月28日止，陸續於25個縣市與當地政府合辦「國家永續發展會議議題蒐集會議」，共蒐集900多項議題；在國家發展願景方面，希望能從組織改造、環境權入憲、建立國家永續發展願景及指標著手，重要議題包括國土永續規劃、能源政策、廢棄物處理、永續交通、水資源、綠色採購及消費、生物保育、海洋及海岸保護、工業區生態化、健康人口及社區、綠色產業、永續教育等事項，相關資料將進一步彙整分析，提供日後相關會議討論。
國家永續發展會議將以永續環境、永續經濟、永續社會為範疇，邀請各界關心國家永續發展之產、官、學、民意代表及團體代表等人士參與，以創造環境保護、經濟發展及社會公義三贏局面。歡迎各界踴躍參與並提供建言。該署並已建立各界對「國家永續發展會議」之聯繫平台，於網站設置「永續發展專案」網頁，提供相關活動訊息及意見反映，相關建言亦可直接e-mail至電子信箱（chenhw@sun.epa.gov.tw）。