生物技術與電子科技被並稱為本世紀最重要之科技，其中生物科技因其應用面極廣，更被視為最具影響力的科技。環保署最近建立生物技術包括戴奧辛生物快速篩選檢測技術及微生物分子檢測，並實際應用於污染場址整治及環境樣品檢測，除獲得極大成效外，對傳統檢測技術改善亦有極大助益。
近年來，環保署致力於戴奧辛污染場址的整治，但由於界定污染範圍時，常因樣品濃度高低差距過大而導致儀器的污染，此外，傳統高解析氣相層析質譜儀之分析成本高、耗時長，常無法在短時間內完成任務。基於此，環保署引進歐盟認可，由荷蘭所開發的戴奧辛生物快速篩選檢測技術，此技術可應用於各類環境基質樣品戴奧辛的檢測。
環保署實際應用此技術於污染場址整治及環境監測上，除顯示與傳統之高解析氣相層析質譜儀技術有極高線性相關性（準確性高）外，尚具有快速、準確、操作簡單及節省經費等優點。環保署表示，未來大量的戴奧辛樣品如事先經生物快速篩選法先行篩選，必要時再進行化學檢測，如此應可達到準確、快速、省時及節省經費的多重績效。
另微生物檢測為環保署重要工作任務之一，過去傳統檢測技術大多需經培養，再以其生化特性作為鑑定的基準，此方法除耗時外，常因對少數微生物的敏感性較差而導致無法判別。環保署為解決此問題，發展出水體致病菌的即時定量聚合連鎖反應酵素（RT-PCR）檢測技術。由水體樣品中抽取含量極低的沙門氏桿菌及志賀氏桿菌DNA，再經由敏感性極高的即時定量聚合連鎖反應酵素系統，可以成功檢測出水體是否受到此兩種菌之污染，並已成功實際應用於山泉水之病源菌檢測。
環保署建立生物技術的時間雖不到兩年，已獲得初步成效。由於目前生物技術進展極為快速，環保署表示，將配合時代腳步，持續開發及引進環境相關生物技術，達到準確且快速之要求，而有助於國人環境品質之改善。