颱風過後，環境清潔為首要的工作，環保署特別呼籲民眾垃圾清除時將易腐敗、發臭的部分與大型廢棄物分開清理，室內宜用漂白水消毒，戶外積水要清除，飲用水請煮沸後再使用！
環保署提出災後消毒民眾垃圾清理原則（如附件一），請災區民眾首先將垃圾中易腐敗、發臭的部分與其他廢棄物分開堆放，以便當地環保單位規劃，優先清除。在不影響救災及交通通暢下，不易腐敗之廢棄家電或大型傢俱等，如需丟棄，請放置於附近的空地或路旁或暫置於環保單位指定之暫時堆放地點，俾利環保署縣市環保局及鄉鎮市公所迅速進行各項廢棄物清理工作，加速環境之復原。
另環保署也提出環境消毒方法（如附件二），提醒民眾在環境清理過後，宜進行居家環境及器具消毒工作，特別現場示範漂白水溶液配製DIY，選購市售漂白水，成分為次氯酸鈉濃度約為3 %至6 %左右，稀釋100倍，進行室內環境及一般器物擦拭消毒工作。戶外公共環境方面，可請轄區清潔隊協助。
還有為了防止災後居家或戶外積水容器，易孳生登革熱病媒蚊，民眾應盡速檢查包括花瓶、水缸、水塔、冰箱除霜底盤和盆栽植物墊盤等，將積水清除。(清除登熱病媒蚊孳生源自我檢查表如附件三)
蓄水池儲存自來水，需以濃度為200 ppm以上的消毒水溶液 ，清洗蓄水池消毒後，連續清洗2次，並等待30分鐘後，以清水清洗後始可蓄水。同時為了維護自己的健康，環保署再次提醒民眾請將飲用水煮沸後再喝。