環保署與臺南市政府環境保護局近來對臺南市三爺溪流域之事業聯手稽查，共查獲臺南市仁德區3家事業違規偷排高濃度廢水，已依水污染防治法刑責規定移送法辦及勒令停工；經中央與地方強力稽查後，環保署監測三爺溪水質重金屬已明顯改善，河川逐現生機。
由環保署歷年監測二仁溪支流三爺溪水質，發現五空橋六價鉻有偏高超過人體健康基準情形，分析污染來源應為三爺溪緊鄰之事業，環保署環境督察總隊南區環境督察大隊即訂定三爺溪流域督察專案計畫，與臺南市政府環境保護局聯手持續查核，每月採樣監測並利用重金屬快篩試劑分析，發現重金屬仍偶有異常情形，今年為進一步降低事業廢水造成重金屬污染的風險，再篩選鄰近40家高污染潛勢事業搭配快篩試劑強力稽查，結果有31家違反環保相關法令規定，依法處分；另外臺南市政府環境保護局同步於沿岸事業共稽查314家，處分26家，其中有16家為放流水超過放流水標準，而三爺溪水質也在中央與地方強力稽查後，新溝橋測站重金屬六價鉻測值由104年7月最高值4.7(mg/L)，於105年7月以後皆未檢出，河川逐漸恢復生機。
環保署表示，以快篩試劑檢測水中重金屬，再結合多項科學儀器進行水質監測，可於第一時間追查污染來源並蒐集偷排事證，有效減少人力、物力，並節省公帑。今年與內政部警政署保安警察第七總隊第三大隊第三中隊及臺南市政府環境保護局有效查獲金○有限公司、興○來有限公司、進○有限公司3家不肖業者繞流排放高濃度含重金屬廢水，其中金○有限公司、進○有限公司繞流排放廢水含有害健康物質重金屬濃度超過放流水標準逾50倍，經依違反水污染防治法罰鍰額度裁罰準則計算裁罰金額，將近新臺幣2,000萬元，現3家事業均已勒令停工，另將再追繳不法利得；涉犯刑罰規定部分，其中2家負責人及專責人員已遭臺南地方法院檢察署起訴。
環保署除加強稽查三爺溪事業，並協調下水道單位加速推動興建二仁溪沿岸污水下水道系統，在污水下水道未達區域也投入補助新臺幣2.5億元設置了「仁德排水生態礫間淨化設施」、「萬代橋生態礫間淨化設施」及「三爺溪水質淨化場」3項現地處理設施，增加了每日3萬6,000公噸的污水處理量，連同虎尾寮截流，相當削減15萬人的污水量，將可大幅改善河川水質。
環保署表示為維護環境河川水質，整治與稽查雙管齊下，積極推動污水下水道建置與水質淨化設施，以削減排入河系的污染；同時持續強力執法，事業若違法偷排含有害健康物質超過放流水標準，將涉犯水污染防治法第36條刑責規定，最高可處5年以下有期徒刑，行政罰最高可裁處新臺幣2,000萬元、處停工及追繳不法利益。呼籲業者要妥善處理事業廢水，不要抱持僥倖心理，以免遭受重罰得不償失。
民眾若發現污染情事，可撥打免付費公害陳情專線：0800-066666反映，亦可上本署網站（http：//www.epa.gov.tw/）查詢。