為降低農地受到重金屬之污染，行政院環保署（以下簡稱環保署）已於105年首創農地重金屬總量管制，增訂總量管制區管制標準，明定第1級總量管制區內禁止新事業設立。為全面加嚴重金屬管制，落實重金屬排放總量之削減，今(106)年底前將再修正發布放流水標準，對於有運作重金屬之事業或污水下水道系統，加嚴銅等9項放流水標準限值，其中銅及鉛加嚴為現行管制限值50%，其他項目為70%。另對於因被處停工或情節重大等重大違規而經廢止許可證者，3年內不得申請及核發許可證。
環保署105年1月6日修正放流水標準，對於放流水排放至經直轄市、縣（市）主管機關公告之排放總量管制區（內）之特定承受水體者，加嚴鎘、總鉻、六價鉻、銅、鋅及鎳等6項重金屬之管制限值，現行已有桃園市新街溪埔心溪、彰化縣東西二圳東西三圳及臺中市詹厝園圳等3個流域劃定總量管制區。以重金屬「銅」而言，現行放流水標準管制限值為3.0mg/L，若事業位在第1級總量管制區內管制限值加嚴為0.2mg/L，等同於灌溉用水水質標準；工業區污水下水道系統在第1級總量管制區內管制限值加嚴為1.5mg/L，等同於現行管制限值之1/2，其目的在於提供誘因鼓勵事業進駐於工業區當中，由工業區集中管理並收集處理，避免工業區外之事業藉由繞流或其他非法方式排放，導致污染情事發生。此外，105.10.28同步修正水污染防治措施計畫及許可申請審查管理辦法，第1級總量管制區內不得有新設立事業，以避免排放總量提升，且既設事業若違規經廢止排放許可證，亦不得申請核發排放許可證，杜絕重大違規業者。
環保署為再全面強化重金屬污染風險控管，維護水體品質，將於106年發布修正放流水標準，全面擴大重金屬加嚴管制對象，對於水量大於500 CMD半導體業、光電業、化工業、印刷電路板製造業、水量大於150 CMD電鍍業、金表業、金屬基本工業，與科學工業園區、石油化學專業區、工業區專用污水下水道系統等，加嚴銅、鉛、鎘、總鉻、六價鉻、鋅、鎳、硒、砷等9項放流水標準限值，另新增管制項目錫。其中銅及鉛加嚴為現行管制限值50%，其他項目為70%。並將於106年同步修正發布水污染防治措施計畫及許可申請審查管理辦法，對於因被處停工或情節重大等重大違規而經廢止許可證者，3年內不得申請及核發許可證。
綜上，環保署關注農地受到污染情形，持續藉由法令修正強化重金屬管理，106年更大刀闊斧對於所有運作重金屬事業強化管理，即便位於總量管制區外，亦需符合更嚴格之限值，以期水體水質不受到污染。此外，後續再進一步檢討修正總量管制區內之管制限值，杜絕總量管制區內之水體、農地重金屬污染情事。