今（100）年入夏以來，於7月底發生第一例本土性登革熱確診個案後，疫情持續上升，目前疫情以高雄市最嚴重，澎湖縣、屏東縣及臺南市次之。為避免登革熱疫情持續擴散，環保署與衛生署於今（21）日邀集國防部、教育部、經濟部、財政部、交通部及臺南市政府、高雄市政府、屏東縣政府及澎湖縣政府召開「100年第三次登革熱流行疫情處理協調會報」，針對4縣市防治現況及策略進行檢討與調整。環保署沈世宏署長表示「希望地方政府及村里鄰長以挑剔的精神，持續透過大街小巷『巡透透』的巡查清理，並加強民眾宣導工作，檢查再檢查、清除再清除、宣導再宣導的做法，澈底清除家戶內外登革熱病媒蚊孳生源，以遏止疫情。」
環保署登革熱防治推動及策略，係依衛生署「登革熱防治工作指引」以「清除孳生源為主，緊急噴藥為輔」為原則，統計今年1月至10月全國環保機關登革熱防治工作成果，動員病媒蚊孳生源清除約110萬人次，清除容器約533萬個，空地清理3萬7,000餘處，廢輪胎清理約13萬6,000個。此外並結合村里、志義工與環保衛生機關的力量進行登革熱孳生源清除，持續辦理三級複式動員檢查，透過村里互檢、地方環保衛生機關複查及中央環保衛生機關追蹤複查等逐級查核方式，並加入衛生署疾管局「容器減量」觀念，共同防治登革熱。為因應今年疫情變化，加強病例集中地區孳生源之清除成效，環保署已於10月至11月期間再次針對防疫重點縣市（臺北市、臺南市、高雄市及澎湖縣等）辦理第3次三級複式動員清除登革熱病媒蚊孳生源，希望藉由逐級檢查方式，強化並落實孳生源清除成效。
環保署表示，登革熱防治工作除持續宣導民眾定期進行「巡、倒、清、刷」等防治工作觀念，呼籲家戶總動員，加強環境整理、清理髒亂點及清除登革熱病媒蚊孳生源，環保單位亦加強輔導及勤查，對於有違反公共環境衛生者，依「廢棄物清理法」相關規定予以處分。