受到莫蘭蒂颱風影響，高雄市西子灣及金門縣西南海岸均發生船舶擱淺事件。環保署持續掌握相關船隻應變處置進度，與相關部會及地方政府通力合作並提供協助，務求儘速消弭本次海洋污染危機。
擱淺於高雄西子灣的4艘漁船，富冠606號及富冠707號已於昨（16）晚拖離事故現場，並順利泊靠前鎮漁港。另順天606號及永興發168號由於船體傾斜無法拖離，船方委託之海事公司於現場進行水下勘查確認鑽孔位置，一切就緒後將展開抽油作業。環保署為掌握現場狀況，於今日上午以無人飛機進行空拍作業，現場兩艘漁船旁已圈圍攔油索，以防止油污向外擴散，經空拍顯示油污並無擴散至防波堤外側，將持續監控。
另擱淺於金門西南側的大陸籍「港泰台州號」貨輪，今日清晨經海巡署通報及金門縣環保局現場查看，油污已沾附於岸際約200至300公尺範圍，環保局及海巡署同仁於今日上午即動員展開岸際除污作業，先清除沙灘上之油污，合計動員110人並清除500公斤含油水廢棄物，同時海巡署也從海上布設攔油索，避免油污往外漂移。為協助金門縣政府，環保署今日已聯絡海污應變開口合約廠商，派員支援金門清理油污，環保署也由宋欣真簡任技正與合約廠商指揮人員於下午搭機前往金門進行現勘，會先動員其在金門的下包廠商投入清污作業，如評估有不足，再從臺灣調用人力及機具前往協助。
經過環保署初步現勘，「港泰台州號」貨輪已洩漏之油污清理作業，原則上優先雇用當地居民，明（18）日早上會先布設工作通道，先清礁岩油池內的油泥，並刮除沙灘上的油塊，沙灘及礁岩污染區在退潮時進行作業。另由於該船上尚有輕柴油25公噸、潤滑油2.5公噸、廢油水70公噸，交通部航港局今日下午召開「港泰台州輪擱淺應變會議」，於會中要求船方在情況許可盡可能派遣油駁船將上述殘油全數移除，以免洩漏造成污染。
環保署表示，依據行政院核定之「重大海洋油污染緊急應變計畫」，以本次在金門洩漏的油污量，應變權責雖然屬地方政府，環保署從事件發生時就密切與地方政府聯繫全程掌握，在油污發生洩漏後也立即運用開口合約協助地方政府清污作業，共同處理污染應變事宜。本次事件期待在中央與地方通力合作下，早日解除海洋污染危機。