行政院環境保護署張署長國龍關注0612豪雨造成雲林縣等地方嚴重水災洪水消退後之環境復建，於6月19日下午由該署環境督察總隊張晃彰總隊長、雲林縣林源泉副縣長及環保局鄭育麟副局長等人陪同下赴雲林縣台西鄉、口湖鄉及水林鄉等鄉鎮實際了解，允諾全力協助環境復建。
張國龍署長同時指派蔡丁貴、林達雄二位副署長、分別到高屏嘉南等災區給予地方充分協助，併對清潔隊員之辛勞表達崇高敬意與謝意，同時呼籲民眾結合政府力量清理環境及消毒防疫工作，必要時申請國軍支援外亦可發動各鄉鎮義工、志工或僱工或委託民間之廢棄物清理公司及環境消毒公司，以求迅速恢復環境清潔，以免發生惡臭影響環境衛生及疾病之發生，環境消毒所需藥劑環保署已先緊急撥各地環保局，不足時將再全力支援。
至於對災區清理之垃圾、淤泥等一般廢棄物，請環保局協調進入有餘裕量之掩埋場、焚化廠做最終處理。至於環境清理之僱工、租用機具等所需經費，環保署將予以全力協助。