杜鵑颱風來襲可能因豪大雨造成部分地區淹水或積水，環保署提醒民眾在颱風過後清理家園，並注意飲用水安全。環境清理時要注意：(一)將易腐敗、發臭的垃圾與大型廢棄物分開清理；(二)淹水地區水退後，室內消毒民眾可購買坊間市售家用漂白水，依標示適當稀釋(例：1份漂白水加99份水稀釋)進行消毒；(三)清除戶外積水容器，以避免孳生蚊子；(四)飲用水請確實煮沸後再飲用，如有停水後恢復供水時，可先打開水龍頭流數分鐘再取用煮沸，以確保安全無慮。
淹水地區的民眾更須注意環境清理，積水退後請依清理原則首先將易腐敗、發臭的垃圾與其他廢棄物分開堆放，以便當地環保單位優先清除。在不影響救災及交通順暢下，如果要丟棄不易腐敗的廢棄家電或大型家具時，請放在附近的空地、路旁或暫置在環保單位指定的暫時堆放地點，好讓環保單位能夠快速地進行各項廢棄物清理工作，加速環境的復原。
為了防止災後居家或戶外積水容器孳生登革熱病媒蚊，環保署提醒民眾，記得儘速清除戶內外登革熱病媒蚊孳生源，其中民眾對於住家屋頂、菜園、花圃等社區環境，空地、空屋與工地的管理單位尤須加強巡查清理。以「巡、倒、清、刷」、「清除再清除、檢查再檢查」的原則進行環境清理，例如：檢查花瓶、水缸、水塔、冰箱除霜底盤、盆栽墊盤等，並將積水清除及清除廢棄盆栽，留下的器物也要「刷洗」去除斑蚊蟲卵，妥善收拾或予以倒置，以防止登革熱病媒蚊孳生助長疫情。
如發現無法清除積水處或窪地可自行購買或洽轄內區公所、環保單位提供合格環境用藥投藥預防，如百利普芬、陶斯松、亞培松、蘇力菌。環保署已建置「環境用藥許可證照查詢系統」（http://mdc.epa.gov.tw/MDC/search/search_License.aspx）查詢相關資訊，只要鍵入產品名稱或許可證字號，即可查詢所選購的環境用藥是否屬合法登記的環境用藥。環保署呼籲，環境用藥能不用就不用，能少用就少用，以環境用藥防治蚊蟲，只能達到治標效果；為有效防治病媒蚊孳生，應先確實清理環境，尤其在雨後，更要儘速檢查清除住家內外周圍環境的積水容器或積水處，才是滅蚊治本之道。
環保署請民眾注意颱風後飲用水的安全，飲水要煮沸後再飲用，如擔心水有味道，在煮沸後，可將蓋子打開3分鐘以上，讓消毒藥劑揮發變少後再喝。颱風過後地方環保局會加強災後飲用水水質抽驗工作。飲用井水或山泉水等簡易自來水用戶，更應注意確實煮沸後才可飲用，以確保安全，建議住戶管理單位於颱風後清除水井或水池的污泥並洗刷乾淨，必要時可進行消毒，讓住戶喝得更安心。