環保署公布今年各縣市辦理划龍舟地點共19處的水質狀況（如表1），監測結果顯示，19處地點水中溶解氧量皆大於2 mg/L，達水體不缺氧、不發臭的指標，民眾可以放心划龍舟。
19處划龍舟地點中，水中溶解氧量介於2.1至9.1 mg/L之間。在都會區的基隆河大佳河段為4.7 mg/L、新店碧潭為9.1 mg/L、台南運河6.9 mg/L、高雄愛河2.2 mg/L。部分在湖潭、漁港划船的水中溶解氧量，也高達3 mg/L以上，例如碧砂漁港6.6 mg/L、南寮漁港3.57 mg/L、中芸漁港6.8 mg/L及龍潭觀光大池為8.75 mg/L以上。以河川污染指標（RPI）分析，19處有10處為中度污染，2處為輕度污染，7處為未受污染，適合作為划龍舟的水體環境；其中7處未受污染地點適合遊樂用水。環保署提醒，部分地點水質尚未達游泳的程度，也不宜飲用；民眾划船時，若有河川水濺到嘴巴或身體，攜帶礦泉水，以礦泉水漱口或清洗。
環保署表示，爲使河川乾淨，政府採行加速污水下水道系統及污水處理廠興設、加強污染源稽查管制及暗管查察、在污水下水道系統未完成前截流晴天排水進入污水處理廠處理，以及因地制宜採行河川水質現地處理淨化設施，截取晴天排水加以處理後放流回河川以削減污染、活化河岸及增加河川基流量、清除河岸面垃圾等策略，來加速河川的污染整治工作，以達到河川不缺氧、不發臭及水岸活化的目標。
以基隆河大佳河段為例，爲改善基隆河的水質，加速興建內湖、松山、士林及北投區的家庭污水接管，並在大直橋的上游設置南湖礫間（每日5,500公噸）、成美礫間（每日9,000公噸）處理排入基隆河未納入污水處理廠的晴天排水、同時供給基隆河氧氣、運作16台20HP河中曝氣機提供基隆河溶氧每日96公斤。環保署說，基隆河水質已逐年改善，為中度污染（如圖1），污染程度並逐年下降。爲使民眾享受親水佳節，台北市政府也加強開啟上游玉成、南京、松山、撫遠、中山、建國及新生等截流站，將排入的污水截至污水處理廠處理。
以新店溪為例，台北縣政府活化了新店溪碧潭河岸，創造民眾的親水空間；並積極推動新店溪的整治工作，加強稽查沿岸光復排水及秀朗橋附近砂石場，抓暗管防止偷排，停工拆除了6家砂石場，修復開啟永和、中和及中原等截流站進行截流，並於本（98）年3月完成秀朗橋下礫間接觸氧化現地處理（如圖2，3,000 CMD），使新店溪97年平均水質首度降至中度污染以下（如圖3）。目前亦正積極推動江翠礫間接觸氧化工程（28,500 CMD），處理板橋江翠地區晴天排水，期使新店溪全河段波光粼粼。
環保署表示，加速污水下水道系統的興建及家庭污水納入污水處理廠處理為根本之道，家庭污水若未接管，則由雨水道排入河川中，仍須民眾支持並配合家庭污水的接管。為減少事業廢水排入河川，督導地方政府加強污染源之稽查管制及非法排放廢水管線的查察，97年查獲事業非法排放管線有425支，處分4,231萬元，並封閉暗管360支。