二仁溪長期受廢五金熔煉污染，前因不肖業者棄置廢電路板等廢棄物於河道內，近年來河道沖刷，造成部分電路板廢棄場址逐漸裸露，除對環境景觀造成破壞外，長期浸置於水中之電路板等廢棄物恐對河川造成污染。行政院環境保護署為加強二仁溪污染整治，補助（總經費為6,300萬元）高雄縣政府辦理「二仁溪印刷電路板清除計畫」。
本案於95年4月委託財團法人工業技術研究院擔任顧問，並協助監督及製作工程招標文件，95年6月由高雄縣政府發包辦理清理工作；清理工作於8月22日開工，預訂10月31日清除完畢，並進行河堤岸復育工程。預計清除二仁溪南萣橋上游約200公尺處白砂崙場址及300公尺處圍子內場址河床地內4,900公噸廢電路板。
環保署表示，清除出之廢棄物，將分含重金屬有害事業廢棄物及一般廢棄物分別處理。有害事業廢棄物將以太空包打包，編號秤重後送至合法廢棄物中間處理廠，固化後送固化物專屬掩埋場掩埋。一般廢棄物則送合法清理。
另為警示二仁溪污染事件，規劃將部分清除出之廢電路板，以活動參與方式製作成藝術品，預計於95年10月辦理公開創作評比與展覽發表會。有興趣參與廢電路板藝術創作的民眾，可洽高雄縣政府環保局第四課，聯絡電話：07-7351500轉0410詢查報名方式。