鑑於第二期稻作將陸續收割，為避免稻草燃燒造成空氣品質不良，環保署及地方環保局將於空氣品質預報不良期間加強執行稽查，經查獲燃燒稻草造成空氣污染者，依空氣污染防制法可處以五千元至十萬元罰鍰。該署呼籲農民不要燃燒稻草，以免受罰，至於稻草處理技術可就近向農委會各區農改場或當地農政單位洽詢。
環保署表示，每年11月至12月為二期稻作收穫期，農民常以露天燃燒方式處理稻草，因該時期氣象條件常不利空氣污染物擴散，極容易造成空氣品質嚴重惡化，近年來該署及縣市環保局於第二期稻作收穫期間，持續對稻草燃燒行為加強執行稽查管制，本(94)年於空氣品質預報不良期間，將加強透過各種傳播媒體及宣傳管道，宣導農民勿露天燃燒稻草，並加強執行稽查管制，經查獲有稻草燃燒污染空氣事實者，即依法予以告發處分。
環保署指出，稻草曬乾腐化後其實是土壤很好的肥料來源，如果燒掉相當可惜，建議農民於稻作收穫時，採用附掛切割機的聯合收穫機，將稻草斬切後均勻撒佈於田面，經曝曬乾燥後，再翻犁入土中，將可增加土壤的肥力，並減少化學肥料的使用，一舉數得。農民對稻草處理技術倘有疑義，可就近向農委會各區農改場或當地農政單位洽詢。
環保署強調，稻草燃燒產生的濃煙不只污染空氣，同時易造成視線不良，影響交通安全，且對患有呼吸道疾病民眾、老人及小孩等抵抗力較弱者，造成健康的危害，因此特別呼籲農民不要露天燃燒稻草，以免污染空氣而遭受罰款，損人不利己。