環保署為有效處理民眾公害陳情案件，避免引發抗爭，積極建立多元化陳情服務管道，特設立免付費報案電話0800-066666由專人24小時接聽並鍵入電腦資料專案列管，同時提供陳情人上網或電話查詢案件處理結果之機制。為提高公害陳情案件的處理滿意度及提升為民服務品質，該署環境督察總隊三區環境督察大隊主動call out給陳情人，詢問處理情形及滿意度，不滿意再進一步面對面訪談，了解理由後不斷修正、改良處理方式、策略，使得民眾滿意度大幅提升。
該署三區督察大隊辦理全台21縣市環保陳情案件之查處，貴在同仁鍥而不捨之精神與高度責任感，查處案例中，例如北區環境督察大隊接獲民眾陳情桃園縣龜山鄉長庚大學附近非法廢棄物棄置場悶燒，造成空氣污染與惡臭案，於第一時間即聯繫當地環保局、鄉公所清潔隊與消防隊協力處理，並僱用怪手機具挖掘澆灌滅火；惟嗣後陸續仍發生悶燒情事，並分別接獲教育部轉據長庚大學師生代表與民意代表關切來函， 除再次僱請怪手機具及請消防隊配合搶救外，並責成環保局與鄉公所派員於車輛進出口處設置消波塊、土堆及溝渠等障礙物，另設立嚴禁傾倒告示牌，並請環保警察隊加強配合巡邏監控。其後再次會同各相關單位至現場履勘，污染情形已見大幅改善，民眾多表肯定且迄今無再抱怨發生。
其次發生於台中縣東海大學宿舍惡臭污染案，經中區環境督察大隊歷經數月的監控、採樣，總共稽查二十餘廠可能排放惡臭的污染源後，終於確認污染來源，在告發處分限期改善後，並邀集工業區管理中心、事業單位及東海大學教授、員工、眷屬等五十餘人召開臭惡污染控制協談會，業者展現高度改善誠意，經理性溝通已獲控制改善，東大教職員眷也表達理性關切，目前不但空氣污染情形已漸獲改善，雙方也建立良性互動互信基礎。
此外南區環境督察大隊亦曾受理一位台南市民陳情台南縣市交界處虎尾寮附近非法露天燃燒案件前後長達五年七個月之久，環保單位依其舉發內容查處後，均未發現污染情事，令稽查人員疲於奔命。由於這位陳情人困擾南區督察大隊多年，為了避免人力浪費，該大隊與這名陳情人達成協議，日後如再發現污染情事，請其逕撥稽查人員手機，並依其指定時間、地點立即趕赴現場，如查到污染事實就依法辦理，倘無污染，請陳情人伺後不應再以本項污染情事向環保單位舉發。日前該大隊又接獲其舉發，並立即前往查處，惟仍未查到污染情事，稽查人員隨即將查處結果回覆陳情人，本案為避免稽查人力無謂虛耗，該大隊依行政院暨所屬各機關處理人民陳情案件要點第14點規定，陳情報案中心再接到這位陳情人不實舉發污染，就只登記不受理，以維有效處理機制。
環保署環境督察總隊表示，對於陳情檢舉個人資料，民眾不用擔心資料會曝光，該署均有嚴謹保密措施，民眾請放心確實留下聯絡方式，以便稽查人員儘速回覆查處結果。對於處理結果不滿意而一再陳情的案件，除用電話溝通外亦會指派專人親自到府協調處理，讓民眾了解目前問題所在，亦使民眾感受本署執法誠意。該署環境督察總隊及北、中、南三區環境督察大隊今後仍將繼續秉持一貫依法行政的處理態度，積極主動辦理各類公害陳情交辦案件，歡迎全民共同監督維護大家的生活環境。