環保署署長沈世宏關心二仁溪污染整治進度，8月29日與水利署、台南縣、台南市、高雄縣政府、當地居民及民意代表共同現勘二仁溪。沈署長現場除要求各環保機關加強污染稽查及加速推動水質改善工程，並請各地方政府加速完成污水下水道系統建設並妥善處理早年遺留下來的廢棄物問題，以改善二仁溪水質及沿岸環境，早日達成民眾之期待。
沈署長一行首先到二仁溪堤防整建工程的台南縣大甲工區視察廢棄物處置情形。環保署表示，96年水利署第六河川局在二仁溪進行堤防整建工程時，於大甲工區等處發現疑似掩埋廢棄物。環保署立即函請縣市環保局依法查處，並請六河局妥為處置施工挖出的廢棄物，避免污染環境。目前六河局以太空包裝填挖出的廢棄物，移至已完工堤防前等適當地點暫置，並以不透水布鋪底及覆蓋。六河局表示已委託工研院規劃後續清理相關事宜。沈署長除請六河川妥為暫置廢棄物，避免污染環境外，並請其儘速完成後續清理工作。
沈署長指出，為瞭解二仁溪沿岸棄置廢棄物情形，該署於96年補助台南縣、高雄縣及台南市環保局進行廢棄物棄置地點的細部調查與清理規劃，計畫正在執行，預計今年底有初步成果。沈署長表示，20多年前沿岸遭廢五金酸洗及熔煉業任意丟棄廢熔渣、電路板、廢酸等廢棄物，經政府政策上禁止廢五金進口、強力稽查地下工廠，並於90年拆除57家非法熔煉業後，污染情形獲得舒緩。其後，環保署於95年補助高雄縣政府於白砂崙及上游圍仔內完成清除處理約4,800噸含重金屬有害事業廢棄物。白砂崙場址並由舢筏協會結合附近河川志工認養復育，成為二仁溪復育之路的重要里程碑。未來二仁溪下游廢棄物調查清理及水岸活化的工作，將透過相關機關的合作，逐步開展推動。
沈署長搭乘舢筏巡視二仁溪。沈署長表示，二仁溪飽受歷史污染傷害，整治復育之途確是艱鉅任務。所幸在環保署、地方政府及民間的合作下，透過稽查管制、河岸面垃圾清除、成立河川巡守隊、設置水質淨化工程等手段，二仁溪的嚴重污染河段已自92年的100%，降到96年的35%。南萣橋測站之生化需氧量年平均濃度已自91年之10.2mg/L降至96年之6.3mg/L，展現初步成效。未來一旦污水下水道建設完成，削減來自三爺溪的民生污水，二仁溪水質還可望再進一步獲得改善。
二仁溪污染整治目前已初具成效，但仍有進步空間，環保署未來將與相關中央部會、地方政府及當地民間團體及志工持續密切合作，改善二仁溪水質水體環境。此外，也呼籲民眾如有發現不法排放廢污水，請踴躍向環保單位檢舉，以實際行動共同捍衛家園的河川。檢舉電話0800-066-666。