由於「行動電話」能提供大眾無所不在的便捷通訊功能，台灣民眾在使用上幾乎已是人手一機，因此也使得大哥大基地臺如雨後春筍般的設立，目前對於基地臺所產生的輻射電磁波是否有害人體，在醫學上的論證也尚無定論，但仍是民眾相當關心的焦點，因此環保署針對都東部地區行動電話基地臺電磁波進行抽測，檢測結果顯示，其量測值均可符合環保署九十年元月十二日公告的「非游離輻射環境建議值」，民眾可不必過於憂心。
環保署於九十一年九月二十二日至十月六日期間，進行東部地區實地量測，完成抽測宜蘭地區八個鄉鎮的行動電話基地台四十八站，計727個樣本數；花蓮地區七個鄉鎮二十八站，計318樣本數；台東地區七個鄉鎮二十九站，計332個樣本數；總計抽測二十二個鄉鎮，完成一0五站行動電話基地台電磁波量測、一千三百七十七個電磁波抽測樣本。
本次東部地區行動電話基地台電磁波量測統計結果，無論是1800MHz或900MHz系統，其電磁波的量測值均遠低於環保署九十年元月十二日環署空字3219號公告「環境中非游離輻射建議值」，與前已經執行完成的大台北、大台中、大高雄地區所量測結果相互比較，發現台灣四個地區環境中電磁波強度大致接近，尤其是平均值的比較更為明顯近似，其電磁波強度大約介於1.8E-6至2.3E-5 mW/cm2之間。
環保署說；本次東部地區行動電話基地台電磁波抽測，特別篩選偏遠地區如宜蘭縣南方澳、花蓮縣富里鄉、光復鄉、台東縣成功鎮、關山鎮、初鹿鄉等偏遠鄉鎮進行量測，這些偏遠地區的行動電話基地台或環境中的電磁波測值與台灣西部人口較密集區比較，並無發現異常偏高現象，其值大約為「非游離輻射環境建議值」的幾十萬分之一至幾萬分之一不等。
環保署已於九十年五月至九十一年四月間，完成大台北、大台中、大高雄地區行動電話基地台電磁波抽測計畫，檢測結果均低於該署公告的「非游離輻射環境建議值」，並於九十一年六月十八日在該署例行記者會發表，與會記者均肯定環保署對台灣西部三個地區量測結果，確實對台灣地區非游離輻射的現況評估及背景值建立已邁出一大步。
環保署表示；綜觀台灣北、中、南、東四個地區全面性基地台電磁波量測報告，除了可供該署爾後在訂定非游離輻射管制標準的參據，並可提供政府機關（如交通部、經濟部等）或學術界、業界參考，更重要的是本次東部地區基地台電磁波調查計畫的完成，使得台灣四個地區環境中非游離輻射基線資料研究的建立，具全面而且是完整性、整體性建檔，爾後民眾若對基地台電磁波有疑慮，亦將有一定程度的認知與化解。