去（95）年10月媒體報導後龍溪口變色，有一股污水流入，有時呈黑色，有時又會變成磚紅色，使後龍溪出海口看起來像陰陽海一般，民眾懷疑是附近工廠偷排廢水造成，擔心有色廢水含有毒性會影響人體健康及魚獲，希望環保署揪出污染原兇，處以重罰並且停止污染行為。
環保署為徹底查察這股有色污濁水，鎖定附近可疑污染源ⅩⅩ染整廠，派員於該廠放流水排放經過的路徑逐一巡查，未發現有異常排放管線，初步排除有偷排的可能，同時加強稽查取締，除於平時日間進行稽查外，也利用假日及夜間不同時段派員進行稽查，該署統計從95年10月至12月間，環保單位共派員稽查該染整廠達25場次，總計採25次水樣檢驗，結果4次不合格，其中真色色度檢驗均符合規定，其不合格部分已請苗栗縣政府依法處分並要求改善，另外該署為進一步了解該染整廠廢水處理設施各項功能及操作狀況，還特別委託顧問機構執行廢水處理設施功能評鑑查核計畫，針對廢水處理場處理設施之各單元、放流水及承受水體分別採取水樣送檢後進行評估，依評鑑結果，對該廠提出許多改善建議包括：調整活性污泥單元之處理功能及加強後龍溪廢水放流端之河道清理工作等，以減輕環境負荷。
該署表示，目前對染整廠排放有色廢水，於放流水排放標準中訂有真色色度排放限值規定加以管制，染整廠為使排放水符合真色色度
排放限值規定，普遍使用次氯酸鈉或脫色劑來降低色度。如將色度管制標準提高，則業者為符合較嚴格之色度管制標準而過量加藥，將使水中餘氯濃度增加，反而造成環境負荷，故在尚無更為經濟有效之替代技術前，將維持目前管制標準限值。
環保署也呼籲民眾及釣客多多注意周遭的環境，如發現環境污染事件，請逕向當地環保局或環保署舉發（全國環保公害陳情專線：0800-066666、環保署網址：http：//www.epa.gov.tw）。