環保署利用水質儀監測水庫水質變化，讓微囊藻無所遁形。因水質儀每隔15分鐘擷取6項與藻類相關的水質資料，比傳統採樣分析(每季1次)的檢測頻率提高近萬倍，讓水庫管理人員可隨時掌控水庫水質，第一時間因應微囊藻華之衝擊。
隨著氣候變遷等因素，國際間頻傳微囊藻華事件，讓科學家頭痛的是平常與其他藻類和平共處的微囊藻，究竟何時會突然大量生長是完全無法掌握，目前的監控方式多以採樣檢測或派人定時巡視來因應，但是當用肉眼發現藻華時，往往藻量已不可收拾。使用比眼睛更靈敏的儀器來密集監測，24小時不打烊，可以完整地呈現藻類的滋長情形。環境檢驗所在研析超過百萬筆水質資料後，建立了一個如下簡易微囊藻華紅黃藍燈號，作為不同階段應變處理之準據。
環檢所表示，警戒黃燈號之所以比世界衛生組織所採用休憩用水標準(10 ppb)更嚴格，是因為希望在微囊藻萌發的最初期，即能採取管制措施，以收事半功倍之效。當警戒的黃燈號出現時，即時至水庫現場採集並分析微囊藻之種類及數量，必要時對水庫進水方式進行管制。當出現紅燈號時，則表示該水質營養鹽已升高，藻類數量已滋生，這時自來水淨水場取水口需避開微囊藻聚集的表水層。這項作業可以有效在微囊藻異常滋生初期就及時發現，讓水庫管理單位有充裕時間應變，避免微囊藻事件之衝擊到最小。
藻類異常滋生是個跟時間賽跑的競爭，必須搶時間以遏止其禍害於無形。高密集的監測數據，讓毒藻無所遁形，也讓管理者能在毒藻生長初期及早發現及因應。雲端技術讓管理人員能運籌帷幄千里之外，縮短時間與空間的隔閡，隨時隨地在第一線為民眾健康把關。
新聞小辭典：
1.微囊藻：藍綠藻的一種，因體內含有危害肝臟毒素而受重視。
2.世界衛生組織休憩用水管理模式：分三階段管理指引，第1級警戒標準為葉綠素a大於10 ppb，且以藍綠藻為優勢藻種，此時對健康有點影響，但不是藻毒素的危害而是藻類刺激所造成的過敏等影響。第2級警戒標準為葉綠素a大於50 ppb，對健康可有中等程度的影響。第3級警戒標準是水體表面產生藍綠藻浮渣，已不適合淋浴或任何與身體接觸的水上活動。
3.葉綠素：是所有藻類的主要光合色素，呈綠色，它能幫助藻類吸收陽光轉化為其所需養分，當水體中葉綠素偏高時，表示水中藻類過量繁殖，間接也反應了水體優養化程度。傳統分析需要以溶劑萃取再經儀器定量，連續螢光法偵測法則提供一特定波長的光，通過葉綠素後產生特定波長螢光，以即時監控量測，藉以推估藻體總量。