為釐清臺南縣東山鄉永揚掩埋場址內地下水可能之流速及流向，環保署於99年10月6日召開本案爭議處理第8次專家會議，討論第三公正單位地下水調查模擬初步結果，專家會議認為，現有調查模擬資料尚不足以提供專家作成專業判斷，故決議調查模擬單位尚需補充彙整歷來地下水位實測數據，並說明模式模擬條件後，再召開專家會議討論，以釐清爭議。
「永揚環保事業股份有限公司第一類乙級廢棄物處理場環境影響說明書」為台南縣政府90年環評審查通過之案件，惟環保團體及當地村民對於該場址「是否有斷層通過」、「地質狀況為何」、「地下水流況」等質疑爭議多年，環保署為解決民眾的擔心與疑慮，於98年3月主動邀集爭議各方（環保團體、當地村民、開發單位、臺南縣政府、經濟部地質調查所等）開會研商，決議循專家會議機制，就上述3項議題，由爭議各方推薦自己相信且具相關專長的專家，基於科學事實的證據及專家具備之專業倫理，進行理性客觀的討論，並就研判資訊不足部分，委託第三公正團體調查。
環保署迄今共召開8次專家會議，「斷層」與「地質」等2項爭議經公正團體實地鑚井調查模擬及專家會議充分討論，專家獲致共識確認北勢坑斷層位置穿越，並定義出斷層帶及緊鄰破碎帶的寬度。
至於場址「地下水流況」的爭議，專家會議著重於「地下水流向為何？」及「斷層破碎帶是否影響流向？」等2個議題，於99年6月28日第7次專家會議決議委託第三公正單位（美商傑明工程顧問股份有限公司）進行地下水調查模擬作業，該單位自99年7月起進行3個月之鑽井試驗、模式模擬作業，初步調查模擬結果略以：「地下水多流向場址東側」、「滲透係數介於10-5 ~ 10-7m/s」、「北勢坑斷層不透水」等，經第8次專家會議討論，專家認為現有數據資料尚不足以提供專家作成場址地下水流向流速之判斷，要求調查模擬單位蒐集彙整場址附近水井歷來地下水位實測資料，並補充地下水模式模擬相關參數訂定與率定驗證之合理性，再召開專家會議繼續討論。
永揚專家會議召開迄今已逾一年，與會專家均本於自身的學識與專業，提供爭議各方最好的服務，讓專家會議機制運作順暢，爭議事項亦陸續獲得解決，所獲致共識不論有利於爭議哪一方，均為爭議各方所接受，經得起爭議各方一起與一再重複驗證。環保署強調，永揚專家會議機制運作之成果斐然、有目共睹，環保署特別對於參與本案討論之專家，表達感謝之意。
近來環保團體將爭議焦點延伸至烏山頭水庫是否會受污染的範圍，已超出永揚專家會議原成立所賦予之任務與討論之範疇，惟環保署仍重視民眾團體的擔心疑慮，環保署已另組成「烏山頭水庫飲用水水源污染與否專家會議」，期望能妥善處理釐清民眾團體所提擔心疑慮。