環保署環境檢驗所最近一期淡水河系新店溪的魚類生態調查結果出爐，共發現38 種魚類，較前一期之27種，大幅增加11種為近年來最高。其中代表水質佳之洄游型的日本禿頭鯊、眼斑厚唇鯊以及消失多年的翹嘴紅鮊均現蹤中下游(附圖)。相較於民國91年調查結果，魚種數足足增加了兩倍之多。國內整治淡水河的成效，也由魚種數及絕跡廿幾年的日本禿頭鯊之再度現蹤，驗證淡水河整體水質已大幅改善。
該所表示把水質改善讓居民願意再度親近河川，讓大家回想起快樂的童年戲水記憶，是環保署重要工作項目之一。而魚類為大眾所熟知且肉眼可見之水生生物，因此魚類常做為河川整治成功與否之指標，例如英國泰晤士河整治成功，即以指標魚類-鮭魚重回該河作為驗證目標。
生物物種調查是評估環境變化對生物衝擊的方法之一，過去國內外常以化學方法分析水質。近年來，歐美先進國家亦同時開發生物毒性檢測做為輔助，所謂生物毒性檢測，就是使用生物活體來檢測水質樣品中的毒性對生物體之影響，藉由最敏感生物之把關，讓水中微量之污染物無所遁形。而單一生物並非對於所有毒性物質均敏感，所以需要用不同種類生物進行測試。因此，該所自民國82年起開始進行適合國內之生物毒性檢測標準方法之開發，經多年之努力，前後共完成6種不同生物急毒性測試方法，包括脊椎動物-魚類(鯉魚、羅漢魚及溪哥)、無脊椎動物-甲殼類(米蝦及水蚤)及植物-藻類(小球藻)等。測試時，只要把小小幾公分的生物放進水裡，最多觀察4天，就能知道工廠放流水到底對生物是否具有毒性，是目前相當有效且簡易之檢測方法。
但環境水體除高濃度有毒物質污染物外，如持久性有機物、環境荷爾蒙、抗生素及衛生用藥等，也逐漸成為國人關切之焦點，而這類物質如環境荷爾蒙之毒性屬於慢性危害如使雄性雌性化等，是目前已開發生物急毒性測試方法無法偵測。因此，該所目前正在開發水蚤等生物之慢毒性測試法，經由28天之暴露，進行是否會造成畸形或生長異常等之危害評估，而此方法預定於明（100）年將公告以供相關單位參考。
該所強調評估方式雖然簡單有效，但由於生物毒性測試所需之試驗生物須在控管環境下進行飼養，再加上需依一定程序進行重複實驗，並非隨便找生物體測試即可。對此技術有興趣之業者，該所提供免費技術轉移，於業者提出申請後，將安排後續技術轉移事宜。