近日豪雨侵襲台灣，造成屏東縣、台南縣、嘉義縣、雲林縣等沿海地區淹水，而高雄縣、台中縣、南投縣等山區亦有土石流災害。行政院環境保護署張署長國龍特別指示全署傾力協助淹水地區環境清理工作，並於本(12)日親赴台中縣及雲林縣訪視災情，了解當地在豪雨災後環境清理進度，同時亦指派該署張副署長子敬及林副署長達雄分赴台南縣、嘉義縣及屏東縣、高雄縣等南部受災地區瞭解災情。
張國龍署長先至台中縣瞭解緊鄰后里垃圾資源回收（焚化）廠之大甲溪堤防崩潰情形，後即趕赴至雲林縣台西鄉淹水地區巡視災後環境清理工作，張署長表示環保署會提供地方必要協助，以儘速完成災後環境復原工作。張國龍署長對清潔隊員及國軍官兵持續進行淹水地區環境清理工作的辛勞，表示肯定與感謝。
環保署為協助受災縣市淹水地區之消毒需要，已主動先行緊急提供1400公升消毒藥劑，可消毒面積1400公頃。藥劑分送雲林縣環保局400公升、嘉義縣環保局400公升、台南縣環保局600公升。根據環保署資料顯示，截至6月12日為止，本次水災災後地區之地方環保機關已動員840人次、清理垃圾量353公噸、清理污泥量190公噸，目前仍持續全力清理中，在清理乾淨後，將迅速辦理環境消毒。
為避免登革熱流行，環保署特別籲請籲請各地災區民眾，對於居家環境應主動清理，在淹水消退後，尤應特別注意室內外容易積水的地方及積水容器，迅速排除積水，及清除不必要之容器，以免孳生傳播登革熱之病媒蚊。