為加強藥品容器回收處理管道，並增進資源回收再利用，環保署已預告修正公告「應由製造、輸入業者負責回收、清除、處理之物品或其容器，及應負回收、清除、處理責任之業者範圍」公告事項二之表二，將「成藥」、「醫師藥師藥劑生指示藥品」（指示藥）等藥品之容器納入公告應回收項目，並規劃自99年1月1日起實施。
環保署表示，目前藥品廢容器的回收管道，於醫療院所排出者，依衛生署訂定「醫療事業廢棄物再利用之種類及其管理方式」，交再利用機構製成原料再利用；於家戶排出者，可依公告執行機關(清潔隊)一般廢棄物回收項目材質，交由清潔隊回收。
有鑑於裝填藥品之容器常有殘留藥物，如遭任意丟棄或隨垃圾進入焚化爐，仍有污染環境之虞，應加強回收處理管道。未來納入公告為應回收項目後，藥品的製造、輸入業者，須依廢棄物清理法第16條規定，向該署辦理責任業者登記、申報營業（輸入）量及繳交回收清除處理費。業者繳交的費用可用來補貼回收業者，提高其回收誘因，促使藥品廢空瓶能妥善回收處理。
環保署強調，本次修正公告回收的主體是藥品的容器（空瓶），且以標有「成藥」、「指示用藥」字樣之容器為限，標有「處方藥」字樣之容器則不在公告範圍。另外，民眾家中如有過期、剩藥仍應先依循藥品主管單位規定將藥品回收處理，再將藥品空瓶交由清潔隊或回收業者回收。
環保署指出，修正草案已詳載於該署網站「法規命令草案預告區」網頁（網址：http://ivy3.epa.gov.tw/epalaw/index.aspx），各界對公告內容如有任何意見或疑義，可於草案預告期間或公聽會時提出。