環保署為確認台東美麗灣是否如報載「又動工」，於99年4月12日派員現勘，確定並無媒體所指情事。
台灣立報於99年4月5日「中科效應 台東美麗灣又動工」報導，引起民眾對美麗灣開發案現況的關心，環保署指出報導的內容多有謬誤，並依事實向台灣立報澄清，但台灣立報又於4月8日「回應環署對美麗灣跟橫山的投書」一文指稱業者正進行內裝。環保署為求慎重，已派員前往確認是否有進行內裝、施工情況，結果並無其事(詳所附照片)。
環保署表示，當日會同台東縣環境保護局人員至原施工地點現勘，發現工地以圍籬封閉，現場出入口設有警衛24小時看守，原興建尚未完成之旅館區已停工多時，現場散置砂、磚、隔熱棉等部分材料，停工前完成施作部分均呈現破損銹蝕，經現場情況判斷，應已停工多時，並無台灣立報所指情事，但原規劃二期Villa、三期旅館區則完全無動工現象。環保署藉此呼籲媒體登載之事件應請嚴謹查證。
環保署表示，為持續監控該案情況，將請台東縣環境保護局每週派員前往察看，該署並歡迎所有民眾一起參與美麗灣開發案之監督，如發現該案有違法開發情事，歡迎向該署或台東縣政府檢舉。