行政院張院長善政關心德翔臺北輪殘油抽除及貨櫃吊卸執行進度，今（6）日第4度至現場應變中心視察，並聽取相關部會簡報。交通部航港局表示，至下午4時止德翔臺北輪後段甲板上已移除38個貨櫃，剩餘3個貨櫃將於乾潮時儘速移除；該局將持續督促船東照今日向院長簡報之規劃方向，儘速提出船艙內殘油處理詳細計畫與船體後續移除計畫，把握時間於颱風季前展開移除工作。另為確保漁民損失求償權益，院長已指示農委會漁業署督促船東，儘速於今晚(4月6日晚上)與保險公司確認損害證明認定方式，以免因拖延導致漁船無法出海，造成漁民損失引發民怨。
中央應變中心持續於新北市石門區公所召開油污染現場應變中心會議，由環保署符副署長樹強主持。環保署今日持續以無人駕駛航空器系統（Unmanned Aircraft Systems, UAS）及岸際雷達車進行海面污染監控作業，觀測結果顯示船隻右舷後方海面未發現明顯油污情形，草里漁港及核一廠進水口鄰近海面亦未發現油污，顯示先前調整攔油索之布放位置已發揮功能。
有關第三貨艙殘油，船東今日持續以人工進行除油，應變中心將持續督促船東加速殘油移除作業，於作業期間持續監督船東加強船側攔油索及吸油棉索布設及派遣漁船執行外海油污染清除作業，以減少海上油污擴散。今(6)日岸際清除作業總計投入258人次，清除垃圾量1,950公斤、油污水2,380公升。環保署要求船東每日清除之油污垃圾應於當日清運完畢，並確實委託合法廢棄物清運公司辦理。
環保署表示，各單位在進行相關油污染應變工作時，務必以人員安全第一、盡最大力量除污及避免抽油作業二次污染為最高指導原則，本次擱淺事件期許在各機關單位共同努力之下，進行相關應變工作，以維護海洋環境生態。