莫蘭蒂及馬勒卡颱風相繼來襲，因豪大雨造成部分地區淹水或積水，在各地環保機關的緊急處理下，除離島地區金門縣外，其餘受災縣市（臺北市、新北市、基隆市、宜蘭縣、臺南市、高雄市、屏東縣、臺東縣、花蓮縣、澎湖縣）表示可於今日完成主要幹道環境清理，恢復市容，明(19)日民眾上班前市容已恢復。環保署提醒民眾在颱風過後清理家園，並注意飲用水安全。環境清理時要注意：(一)將易腐敗、發臭的垃圾與大型廢棄物分開清理；(二)居家環境消毒，民眾可購買坊間市售家用漂白水，依標示適當稀釋(例：1份漂白水加99份水稀釋)進行消毒；(三)加強清除戶外積水容器，以避免孳生蚊子；(四)飲用水請確實煮沸後再飲用，如有停水後恢復供水時，可先打開水龍頭流數分鐘再取用煮沸，以確保安全無慮。
部分淹水地區的民眾更須注意環境清理，積水退後請依清理原則首先將易腐敗、發臭的垃圾與其他廢棄物分開堆放。為加速環境清理，如果要丟棄不易腐敗的廢棄家電或大型家具時，請放在附近的空地、路旁或暫置在環保單位指定的暫時堆放地點，好讓環保單位能夠快速地進行各項廢棄物清理工作，加速環境的復原。
為了防止災後居家或戶外積水容器孳生登革熱病媒蚊，環保署提醒民眾，記得儘速清除戶內外登革熱病媒蚊孳生源，尤其是住家屋頂、菜園、花圃等社區環境，例如：花瓶、水缸、水塔、冰箱除霜底盤及盆栽植物墊盤等積水容器，並將積水清除及清除廢棄盆栽，留下的器物地要「刷洗」去除斑蚊蟲卵，妥善收拾或予以倒置，以「巡、倒、清、刷」，「清除再清除、檢查再檢查」的原則進行環境清理。另空地、空屋與工地的管理單位也應加強巡檢清理，以防止登革熱病媒蚊的生長助長疫情。
環保署統計受災縣市已抽驗飲用水217件均合格，提醒民眾注意颱風後飲用水的安全，飲水要煮沸後再飲用，如擔心水有味道，在煮沸後，可將蓋子打開3分鐘以上，讓消毒藥劑揮發變少後再喝。飲用井水或山泉水等簡易自來水用戶，更應注意確實煮沸後才可飲用，以確保安全，建議住戶管理單位於颱風後清除水井或水池的污泥並洗刷乾淨，必要時可進行消毒，讓住戶喝得更安心。