非洲豬瘟中央災害應變中心宣布8月30日起廚餘停止進入養豬場，9月1日至9月30日養豬場暫停使用廚餘餵飼豬隻。為確保國內廚餘清運及處理不受影響，環保署超前部署、不分假日，自8月26日起每日邀集22縣市環保局召開應變會議預為因應，討論防疫期間如何確保民眾、餐廳、機關、廚餘清運業者、廚餘養豬場等單位的廚餘不受影響，完備廚餘去化應變措施，並由環保署及各縣市環保局建立單一服務窗口及指定地點。
環保署表示，廚餘收集方式，由各縣市因地制宜調整，請民眾配合轄內縣市規定之方式排出；餐廳、機關、學校、旅館、社區大樓等單位請將廚餘交給原委託之廚餘養豬場或廚餘清運業者，清運至環保單位指定之地點，免費提供處理廚餘。如有養豬場不再協助清運，則請聯繫縣市指定窗口，由清潔隊協助清運或委託合法清除業者清運，環保機關將全體總動員全力協助廚餘清運及去化。
相關單位如有廚餘清運及處理問題，環保單位已設有專線電話提供民眾、清運業者及廚餘產出源諮詢服務或可到環保署的網站(https://wcds.epa.gov.tw)，查詢合法廚餘清運業者名單。
因應廚餘處理方式的改變，自8月30日起，依廢棄物清理法第31條列管應網路申報廢棄物流向之事業，改由廚餘收運業者以紙本方式申報，事業單位僅需確認簽章即可，簡化相關申報機制。
環保署表示，事業負責人或相關人員千萬不可有任意棄置廚餘之行為，如經查獲任意棄置致污染環境，將依廢棄物清理法第46條規定裁罰，可處1年以上5年以下徒刑，得併科新臺幣1,500萬元以下罰金。最後環保署呼籲全民共體時艱，配合惜食減量、剩食打包，廚餘瀝乾、分類再排出；在此疫情期間，若有可疑肉品請丟垃圾車，勿放入廚餘桶，交由清潔隊妥善處理。請國人與政府一起努力，守住全臺養豬場的最後一道防線，守護國家淨土。