雪山隧道自通車以來，環保署高度關切與重視民眾健康及行的安全，為確認隧道內之空氣品質狀況，釐清民眾疑慮，已於今（95）年7月18日起進行包含一氧化碳（CO）、氮氧化物（NOX）、粒狀污染物（PM10）等空氣品質濃度監測，初步獲得空氣品質監測結果CO為6.9±5.4ppm（最高小時濃度為51.1ppm），NOX為535±310ppb（最高小時濃度為3416ppb），PM10為50±28 g m-3。其中CO及PM10低於目前國際上普遍引用之世界道路協會PIARC（Permanent International Association of Road Congress）所制定之隧道空氣品質標準（CO濃度值應介於100至150ppm，郊區隧道為250ppm），且低於雪山隧道通風運轉的75ppm設計標準，另NOX測值與國外之長隧道測值相當。
有關媒體報導「雪隧氮氧化物濃度高駕駛易昏睡 環署無監測數據」乙事，環保署提出澄清，強調由於隧道內之空氣品質會受車流量、車速、道路坡度、例假日等因素之影響，為充分了解雪山隧道在尖峰時段、非尖峰時段以及南下、北上不同隧道孔內的各種空氣品質狀況，以提供民眾完整且具代表性的監測數據，該署除已完成進行南向（台北至宜蘭）路段之監測外，目前相關監測工作仍在進行中，待完成整個監測作業後，該署將會公布監測結果，對於9月29日報載該署不願公布監測結果，應是誤解。
環保署表示，營運中之隧道空氣污染問題主要為車輛排放之一氧化碳及煙塵，為確保行車安全，國際上普遍規範的隧道空氣品質標準為一氧化碳濃度及能見度容許值，國內的雪山隧道與全世界主要長隧道的工程設計一樣，均已考慮維護隧道中空氣品質及通風狀況，在正常行車狀況，這些污染物均可有效排出，不會造成不良影響。
目前世界道路協會PIARC的隧道空氣品質標準尚無氮氧化物濃度標準，但國內雪山隧道初步監測的氮氧化物為535±310ppb，其瞬間最高濃度可達3416ppb，遠高於環境濃度，雖與國外長隧道的監測數據相當，但如果隧道內通風系統故障或在持續嚴重塞車情形下，於隧道內停留時間太長，對行車民眾健康的影響仍值得關注。環保署提醒雪山隧道管理單位今後如舉辦類似雪山隧道內一日遊活動時，請加強隧道內之通風及車輛流控管理。該署同時強調，嗣後仍將持續關注雪山隧道內之空氣品質狀況，掌握相關監測數據，並提供民眾參考，確保民眾健康及行的安全。