為再現雲林溪清淨河川，「雲林溪掀蓋段污水截流工程」在雲林縣張縣長麗善及環保署葉主任秘書俊宏的見證下動土，開啟雲林溪水清河美新頁。
雲林溪掀蓋段污水截流工程總經費約新臺幣3億4,000萬元，其中環保署補助82％計2億7,880萬元，規劃截流雲林溪掀蓋段兩側長度約866M計45處排放口之生活污水，預估每日將截流每日平均污水量約4,355立方米/日(CMD)（尖峰污水量11,391CMD），再送至斗六水資源中心進行處理後，預估每年將削減量生化需氧量（BOD5）約92,529公斤/年、懸浮固體（SS）約63,697公斤/年，將可以提升雲林溪掀蓋段後的水體水質，避免兩側生活污水再排入溪後產生水質惡臭問題。
雲林溪早期以河岸景色綠意優美聞名，但隨都市發展後將雲林溪加蓋成停車場，雖暫掩臭味，但同時埋掉在地民眾的共同回憶，為重新喚起民眾對於雲林溪的記憶，促進河川再生，環保署與雲林縣政府推動本項整治工程，期許在經過妥善完善規劃後，厚重的水泥頂蓋掀開後，再現雲林溪的風華，讓縣民久盼親水夢成真，藉雲林溪水岸更新，成為都市的新環境地標。
為積極改善水環境，環保署近年來補助雲林縣政府進行水污染源稽查管制、河川巡守、污染緊急應變、污染源總量管制等工作，以及推動雲林溪、虎尾排水、崙背排水等河川水質改善工程，未來仍會將配合「前瞻基礎建設計畫-全國水環境改善計畫」持續補助雲林縣政府辦理河川整治與水質改善工作。
環保署葉俊宏主任秘書表示，環保署會積極與地方政府通力合作，透過現地水質淨化處理，逐步改變都會區河川水質，除了還河川一個乾淨清澈的形象，也藉由市區水域環境的再造，提高市民的生活品質。