為持續關切國道第二高速公路後續計畫（即國道三號福爾摩沙高速公路）開發營運對紫斑蝶遷徙之影響，環保署於本（99）年度紫斑蝶遷徙高峰前夕，派員辦理開發案環境影響評估監督，對於開發單位交通部台灣區國道新建工程局委託專業研究並已採行多項協助紫斑蝶跨越高速公路的措施，環保署表示肯定，並促請開發單位持續努力，使開發與環保能兼籌並顧。
環保署表示，高速公路之闢建係屬線狀開發，對於遷徙性之生物具有相當大之影響，如何使負面影響降低，為環境影響評估關切議題之一。國道三號福爾摩沙高速公路之闢建，對於國內南北部軸向交通便利性具有極大助益，但開發營運過程中，發現紫斑蝶向北遷徙的過程，需穿越高速公路，尤其在林內段里程251公里附近，有一處紫斑蝶穿越高速公路的熱點路段，如未採取適當的保育對策，紫斑蝶於跨越高速公路時，易遭高速行駛的車輛及其所產生的氣流干擾或直接衝擊，造成大量傷亡。
為降低紫斑蝶穿越高速公路的傷亡風險，開發單位乃委託專業團隊進行研究，並於96年開始採行包括設置防護網及封閉高速公路外側車道在內之多項試驗性措施，並逐年檢討成效進行改進。
紫斑蝶每年向北遷徙之高峰期約在清明節前後，為瞭解本年度開發單位對於保育措施之規劃與設置情形，環保署於99年3月23日派員前往國道三號公路林內路段實地執行環評監督，經開發單位說明及現地查核，本年度其所採行之保育對策包括增長設置4公尺高之連續防護網860公尺（較去年增長200公尺）及部分防護網增設雙層增加視覺量體、封閉高速公路外側車道及路肩、植栽引導設置及維護等措施，亦將進行紫斑蝶飛越國道流場數值模擬分析(大型車)之研究，本年度並提出「紫斑蝶輸運計畫」以加強對用路人之宣導，提醒用路人注意及配合管制措施。依照開發單位之委託研究結果顯示，採行相關保育對策後，紫斑蝶遷移行為於調查期間統計之平均致死率已由96年的千分之20至30，降低至98年的千分之4.655，成效顯著；對於開發單位的用心與努力，環保署表示肯定，並期許開發單位擴大研究成果，持續投注心力於環境保護與生態保育。
環保署表示，環境保護與生態保育是國家永續生存的命脈，雖然經濟發展過程中無法避免進行工程開發，但透過相關環境保護與生態保育對策的研究與落實執行，降低負面衝擊，應是國人、各開發單位與政府機關在推動國家發展中所應共同努力，期能兼籌並顧，以創造優質台灣的美麗願景。