本次艾莉颱風侵台，環保署統計各縣市及各自來水事業單位通報資料截至目前為止，全國大部分地區之自來水供應均正常供給，惟台灣省自來水公司第二區管理處轄屬大湳給水廠鸢山堰取水口及桃園大圳取水口遭受雜物阻塞取水量劇減，目前計有桃園縣（桃園市、蘆竹鄉、龜山鄉）及台北縣林口鄉等地區自來水民生供水受影響（減量供水），受影響戶數80，000戶，自來水事業單位已積極搶修處理中。
為確保飲用水水質安全，環保署已督促地方環保局及自來水事業單位加強飲用水水質抽驗工作，累計至目前飲用水水質計抽驗54件，均合格。環保署表示，颱風期間除持續加強飲用水水質抽驗工作外；該署並提醒民眾，若自行引用山泉水、井水等簡易自來水用戶應確實消毒或煮沸後再飲用。
環保署再次呼籲，災區民眾若對飲用水水質有疑慮，可洽當地環保局（各縣市環保局在其網站上均留有聯絡電話或為民服務電子信箱）或撥打環保署服務專線─0800231885尋求協助。