環保署94年辦理「毒性化學物質環境流布調查」計畫，進行淡水河、頭前溪、濁水溪、大甲溪、二仁溪、北港溪及秀姑巒溪等7條河川豐、枯水期底泥及魚體總汞含量檢測工作。本次汞之調查係委託國立成功大學環境微量毒物研究中心團隊辦理，依調查結果顯示，底泥總汞含量之平均測值為0.057mg/kg（乾重），已較低於美國河川底泥平均測值0.275 mg/kg（2003年），另與92年度該署於後龍溪等12條河川底泥之平均測值0.090 mg/kg（乾重）相較亦有降低趨勢。
7條河川魚體總汞含量之平均測值為0.051mg/kg（濕重），依文獻顯示魚體總汞中約有90%以上為甲基汞換算後，所有測值均未超過行政院衛生署公告之魚蝦類衛生標準﹙迴游性魚類除外﹚甲基汞含量0.500 mg/kg（濕重）。且與92年度環保署於後龍溪等12條河川魚體之檢測平均值0.200 mg/kg（濕重）比較亦有降低趨勢。
環保署強調，為加速降低汞於環境中流布所造成之危害，並與國際間「逐步限汞，最終禁汞」的潮流接軌，該署已於94年12月30日公告自97年1月1日起禁止汞用於製造水銀溫度計，以降低國內汞的使用量。如民眾在居家生活中不慎將水銀溫度計散落地面或破損時，請以眼藥水滴管、注射管、書籤、名片或塑膠片等來收集，絕對不要使用吸塵器，甚至以任何方式加熱水銀，亦不要使用掃帚或是任何毛巾來處理或是擦拭散落處，避免水銀擴散。收集到的水銀請以氣密堅固的容器貯存，並將瓶蓋以膠帶封死及加以標示，最後再交予清潔隊清理。該署亦呼籲民眾於選擇家用溫度計時，請採用電子儀器或不含水銀之替代品來取代過去常用的水銀溫度計，共同為環境永續盡一份心力。