環保署為持續為鼓勵我國國民、獨資、合夥或法人儘速並踴躍淘汰二行程機車及新購電動二輪車，於105年12月23日修正發布「淘汰二行程機車及新購電動二輪車補助辦法」，將補助期間延長至108年12月31日止，並明定自109年1月1日起不再補助淘汰二行程機車；另針對執行期間各界反映之問題適度調整相關補助規定。
環保署表示，二行程機車相較於四行程機車，碳氫化合物(HC)排放量約為18倍，一氧化碳(CO)排放量約為2倍，污染嚴重。為減少二行程機車之污染排放，該署透過加嚴標準已促使國內自93年起不再生產銷售二行程機車；而對於還在使用中的二行程機車，則自97年起提供補助鼓勵其淘汰。惟依據交通部車輛登記資料統計，截至105年10月底止，二行程機車仍有約126萬輛，而電動二輪車（電動機車、電動自行車及電動輔助自行車）相較於傳統引擎機車，具有低污染及低噪音的特性，環保友善程度高，值得推廣使用，因此該署鼓勵淘汰二行程機車及新購電動二輪車。
環保署說明，明（106）年該署將補助淘汰二行程機車每輛新臺幣1,500元；新購電動二輪車視車種不同每輛2,000元或4,000元；淘汰二行程機車並新購電動二輪車視車種不同每輛5,000元或7,000元，部分地方政府也會加碼補助，但補助金額將逐年降低（詳附件），詳細補助資訊亦可至該署低污染車輛補助資訊網（http://mobile.epa.gov.tw/LowPoll/）查詢。
環保署強調，該署將自109年起不再補助淘汰二行程機車，相關補助金額亦採逐年遞減的方式，該署呼籲二行程機車的車主儘早將二行程機車淘汰，改用大眾運輸或購買電動二輪車來代步，不僅減少空氣污染，維護大眾健康，還可獲得政府較高的補助，一舉數得。