環保署表示，支持地方政府推動自行車公共租賃系統，針對各地方政府有意推廣自行車公共租賃系統，補助原則如下：
（一）針對地方政府如欲辦理公共自行車租賃系統者，先期規劃評估案件，原則上酌以補助，並以500萬元為限，協助各縣市政府辦理先期評估作業，俾利設置後能自給自足永續經營。
（二）對設置完成即將運轉之案件，經評估該公共自行車租賃系統具取代民眾通勤私人運具之使用效益，且在提出永續經營規劃策略之基礎下，完成可行性財務規劃分析，可酌以補助短期（以3個月為限）之推廣措施，以期達到短程機車騎乘者轉移使用自行車之目的，減少車輛污染排放之目標。
臺北市政府宣布微笑單車（YouBike）自104年4月1日起取消前30分鐘免費，改收費5元，環保署支持臺北市政府微笑單車（YouBike）永續發展，並贊同使用者付費原則，環保署對地方自行車公共租賃系統補助原則不變。