環保署為強化事業廢棄物管制工作，除逐年擴大列管事業應上網申報廢棄物清理流向外，更藉由現代化資訊管理系統，勾稽比對事業、清除、處理、清理及再利用機構所申報的資料，及將申報異常者，移請各縣市環保局及環境督察大隊進一步至現場稽查告發處分，有效嚇阻業者違法棄置廢棄物。另為避免業者疏忽或不瞭解上網申報規定，而申報錯誤遭受處分，特針對申報異常業者，先以電話與業者確認申報異常原因，對於缺失屬輕微可立即改善者，除給予機會陳述補正外，並輔導其正確申報方式，讓業者體會政府便民用心。
環保署表示，為有效掌握事業廢棄物產出量及清理流向，自87年起逐年公告列管易產出有害事業廢棄物及產出量大的事業，應上網申報廢棄物的產出、貯存情形及清理流向(遞送三聯單)，且配合清除、處理或再利用機構亦需配合該事業上網申報廢棄物清理流向(確認點選接收遞送三聯單)，及申報處理或再利用完成日期時間、再利用產品及數量。截至目前已列管2萬多家事業應上網申報，申報率達96%，大幅提升事業廢棄物管制成效，有效嚇阻非法棄置事件發生。
環保署強調，歷次公告列管事業皆會全面於各縣市辦理宣導說明會，及設置免付費諮詢專線0800-059-777提供諮詢服務，以輔導業者正確上網申報廢棄物清理流向。另為避免業者因疏忽或不瞭解上網申報規定，而申報錯誤導致受罰，除自96年11月22日起提供業者網路申報小幫手e管家服務專區，供業者自我檢查補正及避免再犯錯外，也定期勾稽比對事業、清除、處理、清理及再利用機構所申報的資料，屬輕微異常者先以電話輔導改善補正，屬異常情節重大或屢勸不聽的業者，才進行稽查告發處分，充分給予業者改善補正降低被處分的機會。