「一二三到臺灣、臺灣有個阿里山」，讓阿里山成為臺灣必訪景點，行駛進阿里山的大客車數量也隨之暴增。嘉義縣環保局配合環保署政策，自100年起就將阿里山區域劃為空品淨區，並於111年再依空氣污染防制法第40條規定，將阿里山公路（台18線）63K至94K列入空氣品質維護區（以下簡稱空維區），為目前臺灣海拔最高的空維區。依空維區管制規定，出廠10年以上的大客車，需取得全國自主管理優級標章或一年內有排氣檢測合格紀錄，始得進入，以維護空氣品質，迄今已有105輛不符規定遭受裁處。
此外，嘉義縣環保局於106年曾以空污基金輔導阿里山林業鐵路及文化資產管理處（以下簡稱林鐵處），將穿梭於阿里山的柴油動力小火車加裝濾煙器，使粒狀污染物不透光率由7.0m-1降至0.3m-1，改善率達9成5以上；後續林務局更爭取前瞻計畫經費，將全數阿里山森林小火車頭換裝低污染引擎，大幅減少小火車穿梭在鬱鬱蔥蔥的神木及雲海間所排放的黑煙，改善空氣品質。
針對普受遊客喜愛的阿里山特有文化資產「蒸汽火車頭」，林鐵處將蒸汽火車燃料改用煤磚（Biowood、Brique木屑跟碳粒結合之生質燃料）取代煙煤，使排煙不透光率大幅降低。在111年阿里山森林鐵路110周年時，林鐵處展示Shay21號蒸汽火車頭，除了採用傳統工藝擴管技法的鍋爐及古色古香的檜木車廂，呈現文化資產的原貌，配合使用低煙度燃料行駛，讓人感受到滿滿仿古時光的同時，顯現出文化資產與環境保護的共存。
而嘉義林區管理處（以下簡稱林管處）以綠能、綠化及生活減碳為出發點，與在地客運業者及國內電動巴士廠攜手合作，導入10部低噪音、無排氣的電動中型巴士進行觀光遊園接駁，提供優質環保的行車服務，進一步保護阿里山國家森林遊樂區環境。
環保署表示，為維護特定區域空氣品質，各地方政府可依空氣污染防制法第40條規定，因地制宜劃設空維區，透過禁止或限制高污染車輛進入，實施移動污染源管制，截至112年5月31日止，全國已有19個縣市劃設52處空維區。從阿里山的空維區管制情形，證明在高度觀光負荷的景點，也可以透過空維區的劃設，減輕交通工具對區域空氣品質的衝擊，維持阿里山沁人心脾的空氣，成為共利發展的典範。因此，環保署鼓勵各地方政府持續設置各類型之空維區，實施移動污染源管制措施，並透過行政管制及跨單位之響應，共同提升空氣品質，營造優質清新的好環境。