目前依「飲用水管理條例」，公告可使用於飲用水水質處理消毒藥劑有臭氧、液氯、次氯酸鈉、次氯酸鈣、氯化石灰、高錳酸鉀等六種。環保署有鑒於歐美先進國家亦使用二氧化氯（ClO2）作為飲用水質之消毒藥劑，已著手評估使用ClO2作為飲用水處理藥劑之可能性。該署表示目前已完成國內外二氧化氯相關文獻與背景資料蒐集分析，預定於今（94）年十二月底前完成「二氧化氯為飲用水水質處理藥劑」評估報告，如屬可行將同步草擬公告草案，依法制作業程序進行公告。
一般自來水為確保飲用時的安全品質，在處理程序中經常需要適度的添加一些水質處理藥劑。最常使用的氯（Cl2）具有強氧化力與操作為使用上的便利性，且單位成本低廉，所以在傳統淨水程序中一直廣泛用作消毒藥劑。由於淨水場加氯消毒程序中，氯可能會與水中有機物質反應產生危害人體健康提高至鹽風險的副產物三鹵甲烷，故先進國家已以二氧化氯作為替代藥劑。
環保署表示雖然以二氧化氯做為飲用水水質處理時會比傳統加氯消毒產生的有害副產物少，亦較不會與氨氮反應形成氯胺，且有酸鹼度操作範圍較廣、消毒能力較強等優點，但因氣態之二氧化氯反應性極高，不安定，會與有機物劇烈反應，而且在光照射下有爆炸之虞，尤其在運送過程中更易發生爆炸，故在使用上仍需審慎評估其安全性。
二氧化氯在國際上被認為是新一代高效的殺菌和除臭劑；二氧化氯外觀為微黃色氣體，其氣味較氯氣氫淡，極易溶於水，溶解度約為氯氣之十倍，因其氣態的較不穩定，故多半為現場製造而非以氣體方式運送。