有鑑於機車參加年度排氣定期檢驗係法定義務，與汽柴油車參加年度安全檢驗（含排氣檢驗）相同，基於公平原則，因此環保署正規劃自95年起不再提供機車定檢之補助，改由民眾自費辦理，而對於不依規定參加定檢的車主，除將罰款外，並禁止換發行車執照，而原補助機車定檢的空氣污染防制基金，將用於改善油品品質、推廣油電混合車等污染防制措施，進一步改善環境空氣品質。
環保署表示，有鑑於國內機車數量眾多，是空氣污染主要來源之一，為使車主注重平日保養，以有效改善機車排氣污染問題，因此自84年起逐步推動機車排氣定期檢驗制度，目前全省共設立1,995個機車排氣檢驗站，93年檢驗機車排氣超過700萬輛，每輛機車由空氣污染防制費補助80元。目前車輛空氣污染防制費係採隨油方式徵收，每年隨汽油徵收之空污費約8.6億元，其中汽車與機車的比例約為0.79及0.21，即由機車所徵收的空污費僅1.85億元，惟補助全國機車排氣檢驗費用即將近5.6億元，遠超過由機車所徵收的空污費，且佔隨汽油徵收空污費之比例高達65％，已嚴重排擠其他管制措施之施行。
又依據空氣污染防制法規定，使用中之機車應實施排放空氣污染物定期檢驗，因此機車參加年度排氣定期檢驗，與汽柴油車參加年度安全檢驗相同，均為法定義務，而汽柴油車實施定期檢驗，係由車主自費辦理，並無補助。因此環保署表示，為落實使用中機車執行定檢的法定義務及公平性，規劃自95年起改由民眾自費進行機車排氣定檢工作，將不再進行補助。至於原補助機車定檢的費用，將規劃用於油品品質改善、推廣油電混合車等低污染車輛及淘汰老舊高污染車輛等管制措施，以進一步改善環境空氣品質。
環保署表示，機車車主如有未參加排氣定期檢驗，除將罰款外，並將移請交通監理單位配合禁止換發行車執照，而依道路交通處罰條例規定，行車執照有效期限屆滿，不依規定換領而行駛者，將處罰900至1,800元罰鍰，並扣繳牌照，因此該署呼籲所有機車車主，新車出廠滿三年起，即應每年按照行照發照時間辦理年度排氣定期檢驗，以共同為保護環境空氣品質。