環保署於104年9月11日至9月13日邀集中央各部會及全國各地方政府動員所轄員工、清潔隊、環保志義工、社區及企業等民間團體人力及資源，辦理「清除孑孓行動日」活動，進行環境整頓，清除轄內登革熱病媒蚊孳生源，並請民眾落實「巡、倒、清、刷」行動，另請各地方環保局結合每月辦理1次戶內外環境清潔日活動，對於登革熱病例數較集中的臺南市、高雄市及屏東縣，請每週持續辦理1次戶內外環境清潔日活動，執行至疫情控制為止。
本次「清除孑孓行動日」，總計動員政府機關595個及4萬7,894人參與「清除孑孓行動日」活動（其中政府機關1萬3,485人、國軍1萬9,492人、民間團體3,504人、志義工1萬1,413人）、清理積水容器1萬2,998個（其中發現孑孓孳生源2,358處）、髒亂點清理（含空地、空屋）2,555處、側溝清理843處、告發82件、動員894人次噴灑殺蚊劑2,013處及宣導64萬1,544人。（詳附表）。環保署呼籲在疫情未控制前，請民眾持續配合各地方環保局辦理「環境清潔日」活動，落實「清除再清除、檢查再檢查」及「巡、倒、清、刷」工作，清除戶內外孳生源，民眾千萬不可鬆懈。
孳生源無所不在，登革熱病媒蚊在積水處產卵，且雌蚊可分批產卵，幼蟲孑孓約1週後就能羽化為成蚊並成為登革熱病毒傳播媒介，未孵化的蟲卵可存活長達1年，請民眾務必每週至少執行一次家戶內外孳生源檢查，主動清除積水器物，澈底做到「巡、倒、清、刷」；可從建築物立體結構的角度仔細「巡視」家戶內外上上下下積水容器，將積水「倒掉」，不要的器物予以分類「清除」，減少容器，留下的器物也要「刷洗」去除斑蚊蟲卵，妥善收拾或予以倒置，民眾如發現髒亂點可至環保署「清淨家園顧厝邊綠色生活網(EcoLife)」(網址http://ecolife.epa.gov.tw/)通報，並下載「清除登革熱病媒蚊孳生源自我檢查表」(http://goo.gl/DRe3xd)及「登革熱孳生源你一定要知道的事」(https://goo.gl/vKFfNU)隨時檢視居家環境。