有關麥寮電廠排煙脫硫廢水造成鄰近海域水質變化，環署15日主動緊急與該電廠協商，麥寮電廠允諾未來將確實依照環評承諾，妥善處理排煙脫硫廢水至符合放流水標準後排放，以善盡企業環保責任。
麥寮電廠目前採用之排煙脫硫技術，係利用海水鹼度，以吸收去除廢氣中的二氧化硫。排煙脫硫後的廢水pH值呈酸性，之後再與大量的冷卻水稀釋混合，排放至麥寮外海。由海域監測資料顯示，近年來麥寮附近海域酸鹼pH下降，推斷與麥寮電廠排煙脫硫廢水有關。因此環保署主動邀請麥寮電廠協商改善方式。
環保署指出，雖然麥寮電廠目前領有雲林縣政府核發的合法稀釋許可，但排煙脫硫廢水藉由與冷卻水稀釋混合的行為，已造成海域水質受到影響，為此該署今日主動緊急與該電廠開會討論，要求該電廠進一步處理排煙脫硫廢水。經雙方協商後，麥寮電廠同意將排煙脫硫廢水，處理至符合放流水標準後，再與冷卻水混合排放，而非目前須靠與冷卻水稀釋混合後排放，以確保排放海域之水質及生態安全。
至於改善完成之期限，環保署指出，至遲應於該電廠98年許可證屆期前完成，該電廠則表示將儘快完成改善。