整合完成的「空水廢毒管理資訊系統(EMS)(http://ems.epa.gov.tw)」自96年8月1日正式啟用，為使屬廢棄物列管的2萬多家事業順利由單一入口網站辦理事業廢棄物清理計畫書申請、變更或異動，正確上網申報廢棄物清理流向，減少違規申報情事，環保署將於今年2~3月期間於各縣市辦理97場宣導說明會。
環保署表示，去（96）年空、水、廢、毒12項許可資料整合完成後，為輔導已列管屬二種污染源以上將近8000家事業，順利至整合完成的「空水廢毒管理資訊系統(EMS)」確認共同基線資料及辦理許可證換證，已於去年7月於各縣市辦理45場宣導說明會，目前該等業者的上網確認率已達95%以上，充分顯示事業都已能有效使用該系統。為進一步輔導屬於廢棄物列管的2萬多家事業也都能經由「空水廢毒管理資訊系統(EMS)」單一入口網站，辦理事業廢棄物清理計畫書申請、變更或異動，和上網申報廢棄物清理流向，規劃在今年2月12日至3月11日於各縣市辦理97場宣導說明會。
環保署強調，前開說明會將同時邀請新增列管屬二種污染源以上的業者參加，輔導其也能至「空水廢毒管理資訊系統(EMS)」確認共同基線資料及辦理許可證換證。另為避免新列管事業或新設事業仍由空、水、廢、毒子系統辦理許可證申請，造成資料不一致，已請地方環保機關於核發事業管制編號後，輔導業者先行至「空水廢毒管理資訊系統(EMS)」填報基線資料後，再至空、水、廢、毒子系統辦理許可證申請；另已列管的業者如往後欲辦理許可證變更或異動，亦應輔導其先行至「空水廢毒管理資訊系統(EMS)」修正基線資料後，再至空、水、廢、毒子系統辦理許可證變更或異動，避免又發生資料不一致的情形。
環保署表示，因往後屬廢棄物列管的所有事業皆須先由「空水廢毒管理資訊系統(EMS)」登入，進行基線資料填報或確認後，才能再進入廢棄物系統，辦理事業廢棄物清理計畫書申請、變更或異動，及上網申報廢棄物清理流向，不能再直接至「廢棄物系統(事業廢棄物管制資訊網(http://waste.epa.gov.tw)」進行修改，但部分業者仍有違規申報的情形發生，因此輔導其正確申報，籲請所有列管事業皆能踴躍參加說明會，避免違規申報而受罰。