針對觀音海水染黑事件，經由環保單位展開嚴厲稽查後，其中富順纖維工業股份有限公司觀音廠已報請停工進行改善；另外觀音工業區內俊紡實業有限公司於5月29日凌晨民眾向環保署署長陳情，由桃園縣環保局查有非法排放未經處理廢水之情形，該署當日再度派員複查，發現該公司排放之廢水水溫高達39.8，pH值為9.6，皆不符合放流水標準，該署已下令嚴懲。
環保署表示，水污染防治法之罰則包含罰鍰與限期改善，對於違規情節重大者，得命其停工(業)，必要時，並得廢止其許可證(文件)或勒令歇業。該署為明確地方主管機關執法，已於去（100）年9月1日依據該法第73條第8款授權，認定以未經許可登記之管線排放廢（污）水，或繞過現有處理設備將未處理之廢水排放，即為情節重大情形。故環保局如有查獲事業惡性偷排廢（污）水行為，應即命其停工改善並以最高罰鍰額度裁處，不應等待或放縱其再度偷排，方才令其停工改善；此外，因偷排而涉及不法利得者，並得依行政罰法規定予以追繳，不受法定罰鍰最高額之限制。該署已正式函文請桃園縣政府依法嚴處。
環保署呼籲事業單位能確實加強各項污染防治設施，妥善操作維護，並作好各項污染防治（制）工作，以避免造成環境污染，並維護海域資源。一旦查獲確切違法或污染行為，若涉有不法利得亦將依法加重裁處。環保署同時歡迎民眾勇於檢舉，共同打擊不法，維護環境品質。